19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0080 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0080  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  207  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0626  hypothetical protein  83.84 
 
 		 104 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.369246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0205  hypothetical protein  84.69 
 
 		 104 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0384  type IV pilus assembly PilZ  77.32 
 
 		 108 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.892803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0055  hypothetical protein  68.63 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0087  hypothetical protein  80.46 
 
 		 101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423806  normal  0.428785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0047  hypothetical protein  75.86 
 
 		 106 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.090381  normal  0.242113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1495  hypothetical protein  56.7 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0528  hypothetical protein  53.54 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3854  hypothetical protein  53.61 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3800  hypothetical protein  53.92 
 
 		 104 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0398  hypothetical protein  62.96 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3041  hypothetical protein  57.78 
 
 		 92 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1875  hypothetical protein  52.48 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102054  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2410  type IV pilus assembly PilZ  58.89 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00616498  normal  0.0220666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0493  type IV pilus assembly PilZ  62.5 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4775  type IV pilus assembly PilZ  52.17 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0542658  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.76 
 
 		 654 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal  0.657901 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2527  hypothetical protein  42.37 
 
 		 85 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>