23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0626 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0626  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  215  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.369246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0205  hypothetical protein  86.54 
 
 		 104 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0080  hypothetical protein  83.84 
 
 		 102 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0384  type IV pilus assembly PilZ  81.05 
 
 		 108 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.892803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0055  hypothetical protein  73.08 
 
 		 106 aa  157  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0087  hypothetical protein  82.56 
 
 		 101 aa  147  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423806  normal  0.428785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0047  hypothetical protein  70.19 
 
 		 106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.090381  normal  0.242113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0528  hypothetical protein  53.85 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0398  hypothetical protein  57.58 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3854  hypothetical protein  61.05 
 
 		 106 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1495  hypothetical protein  58.76 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0493  type IV pilus assembly PilZ  56.12 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3800  hypothetical protein  59.18 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1875  hypothetical protein  59.6 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102054  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4775  type IV pilus assembly PilZ  53.47 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0542658  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2410  type IV pilus assembly PilZ  60.23 
 
 		 91 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00616498  normal  0.0220666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3041  hypothetical protein  61.18 
 
 		 92 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2527  hypothetical protein  42.37 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.76 
 
 		 654 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal  0.657901 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  36.36 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2795  hypothetical protein  38.6 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  36 
 
 		 79 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2941  hypothetical protein  40.68 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>