20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0384 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0384  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 108 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.892803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0055  hypothetical protein  80.61 
 
 		 106 aa  169  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0626  hypothetical protein  81.05 
 
 		 104 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.369246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0080  hypothetical protein  77.32 
 
 		 102 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0205  hypothetical protein  79.38 
 
 		 104 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0047  hypothetical protein  85.71 
 
 		 106 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.090381  normal  0.242113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0087  hypothetical protein  82.56 
 
 		 101 aa  150  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423806  normal  0.428785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0528  hypothetical protein  58.51 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2410  type IV pilus assembly PilZ  62.92 
 
 		 91 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00616498  normal  0.0220666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0493  type IV pilus assembly PilZ  57.45 
 
 		 109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0398  hypothetical protein  60.22 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1495  hypothetical protein  62.07 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3041  hypothetical protein  60.67 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3854  hypothetical protein  59.77 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1875  hypothetical protein  56.12 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102054  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3800  hypothetical protein  58.51 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4775  type IV pilus assembly PilZ  53.85 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0542658  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2644  hypothetical protein  39.44 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4536  type IV pilus assembly PilZ  29.51 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  36.9 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>