22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0055 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0055  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555564  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0047  hypothetical protein  92.45 
 
 		 106 aa  187  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.090381  normal  0.242113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0384  type IV pilus assembly PilZ  80.61 
 
 		 108 aa  169  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.892803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0087  hypothetical protein  89.66 
 
 		 101 aa  164  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423806  normal  0.428785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0205  hypothetical protein  75 
 
 		 104 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0626  hypothetical protein  73.08 
 
 		 104 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.369246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0080  hypothetical protein  68.63 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0528  hypothetical protein  61.86 
 
 		 107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0493  type IV pilus assembly PilZ  60.61 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0398  hypothetical protein  65.59 
 
 		 105 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1875  hypothetical protein  59.62 
 
 		 104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102054  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3800  hypothetical protein  60.58 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1495  hypothetical protein  59.8 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3854  hypothetical protein  56.6 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2410  type IV pilus assembly PilZ  62.5 
 
 		 91 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00616498  normal  0.0220666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3041  hypothetical protein  63.95 
 
 		 92 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4775  type IV pilus assembly PilZ  53.66 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0542658  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  35.71 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  35.71 
 
 		 79 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2644  hypothetical protein  35.24 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2527  hypothetical protein  44.07 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>