13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2798 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2798  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 85 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2941  hypothetical protein  78.57 
 
 		 85 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2527  hypothetical protein  76.19 
 
 		 85 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2795  hypothetical protein  68.24 
 
 		 85 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4028  hypothetical protein  61.18 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1926  hypothetical protein  36.76 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2411  type IV pilus assembly PilZ  40 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2259  hypothetical protein  31.82 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1467  hypothetical protein  31.17 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  33.77 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4775  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0542658  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5895  type IV pilus assembly PilZ  37.35 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51757  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2383  PAS sensor protein  42.11 
 
 		 654 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>