41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4746 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 86 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  52.56 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  52.56 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  49.4 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  50.6 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  50 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  47.5 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  38.96 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3320  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  39.76 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  39.74 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3553  type IV pilus assembly PilZ  33.75 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5566  hypothetical protein  46.34 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3050  type IV pilus assembly PilZ  35.9 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1603  hypothetical protein  41.43 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2400  hypothetical protein  34.33 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5314  type IV pilus assembly PilZ  31.65 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.947891  normal  0.173027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0827  type IV pilus assembly PilZ  40 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  35 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  36.25 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4529  type IV pilus assembly PilZ  37.18 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.470833  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4028  hypothetical protein  38.81 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  31.25 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4372  type IV pilus assembly PilZ  38.46 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  32.5 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7256  hypothetical protein  31.25 
 
 		 84 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2411  type IV pilus assembly PilZ  35.94 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  30 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0229  hypothetical protein  32.47 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4663  hypothetical protein  33.33 
 
 		 83 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969031  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0652  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6500  type IV pilus assembly PilZ  41.54 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.504949  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1913  hypothetical protein  31.17 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190295  hitchhiker  0.0055716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4006  type IV pilus assembly PilZ  34.18 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0788285 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0689  type IV pilus assembly PilZ  39.29 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.130937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0678  type IV pilus assembly PilZ  39.29 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5895  type IV pilus assembly PilZ  30.77 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2831  hypothetical protein  42.59 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2527  hypothetical protein  35 
 
 		 85 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>