More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3144 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3144  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 364 aa  727    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0444202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0515  transcriptional regulator, LacI family  59.29 
 
 		 369 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21140  transcriptional regulator  47.37 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06380  transcriptional regulator  44.59 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11580  transcriptional regulator  39.21 
 
 		 381 aa  222  9e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0169  transcriptional regulator, LacI family  36.87 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.042764  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3571  transcriptional regulator, LacI family  36.64 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.7 
 
 		 368 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  32.16 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3350  LacI family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 364 aa  135  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  32.16 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  32.61 
 
 		 335 aa  133  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  34.05 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  33.15 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3453  LacI family transcription regulator  35.21 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.364896  normal  0.286826 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  33.15 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.87 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  28.92 
 
 		 335 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  30.4 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  30.87 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  31.62 
 
 		 340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  29 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  29 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.7 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  29 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  29.33 
 
 		 333 aa  126  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.27 
 
 		 338 aa  126  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  31.62 
 
 		 340 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0581  Alanine racemase  33.24 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0953116  normal  0.13709 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.03 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1266  transcriptional regulator, LacI family  33.97 
 
 		 336 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  29.35 
 
 		 348 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.62 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  31.35 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.74 
 
 		 341 aa  123  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  32.25 
 
 		 339 aa  122  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  32.19 
 
 		 372 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.72 
 
 		 341 aa  122  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  30.3 
 
 		 337 aa  122  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  31.35 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1063  LacI family transcription regulator  27.91 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1789  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.18 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3000  transcriptional regulator, LacI family  26.39 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  27.72 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  28.25 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  28.25 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  28.77 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1214  transcriptional regulator, LacI family  30.96 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000107104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3367  transcriptional regulator, LacI family  30.29 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  26.04 
 
 		 333 aa  119  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  28.3 
 
 		 334 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  29.23 
 
 		 338 aa  119  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  31.87 
 
 		 339 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  28.22 
 
 		 344 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  27.06 
 
 		 327 aa  119  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1502  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.81 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.725302 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  32.46 
 
 		 337 aa  119  9e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  29.12 
 
 		 331 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.38 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1461  transcriptional regulator, LacI family  26.24 
 
 		 333 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2581  LacI family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.38 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2680  alanine racemase  32.61 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.769144  normal  0.967228 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  29.09 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  30.81 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  29.43 
 
 		 359 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.38 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  31.01 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01891  putative sugar-binding protein  27.25 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1024  LacI family transcription regulator  31.76 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  26.2 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.35 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  31.55 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  29.08 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  31.65 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0309  transcriptional regulator, LacI family  32.97 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  29.43 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3399  transcriptional regulator, LacI family  32.51 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.89 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  33.15 
 
 		 338 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1069  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.77 
 
 		 328 aa  117  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.209088 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.51 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2751  transcriptional regulator, LacI family  31.58 
 
 		 335 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360192  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  26.65 
 
 		 335 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>