More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0850 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0850  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.261607 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1371  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.29 
 
 		 306 aa  331  9e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.414479  normal  0.531807 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05700  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.85 
 
 		 384 aa  330  2e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00177704  normal  0.0500251 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10090  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.63 
 
 		 304 aa  330  2e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.653732  hitchhiker  0.000000602887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.42 
 
 		 510 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.42 
 
 		 514 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.42 
 
 		 494 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.42 
 
 		 497 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1925  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  46.33 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0337  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.73 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124726  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.84 
 
 		 513 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  44.84 
 
 		 505 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1212  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  45.22 
 
 		 317 aa  258  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0276654  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0333  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.76 
 
 		 315 aa  257  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.88 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2611  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.69 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1214  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.41 
 
 		 381 aa  256  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1921  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.19 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0684564 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.53 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0317  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.48 
 
 		 483 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.64 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0259  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.41 
 
 		 317 aa  253  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0102386  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  40.52 
 
 		 408 aa  252  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  42.05 
 
 		 317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  44.52 
 
 		 471 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  44.52 
 
 		 495 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.22 
 
 		 432 aa  252  7e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.64 
 
 		 320 aa  251  8.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0619  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.04 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124261  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1843  Signal recognition particle-docking protein FtsY  47.96 
 
 		 393 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.14 
 
 		 405 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0359  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.63 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000537839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0925  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.98 
 
 		 494 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  41.45 
 
 		 541 aa  249  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4170  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.22 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.87 
 
 		 416 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.87 
 
 		 416 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.41 
 
 		 515 aa  248  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.64 
 
 		 386 aa  249  6e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104653  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0492  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.58 
 
 		 379 aa  248  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0977518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0632  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.58 
 
 		 410 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.38 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.64 
 
 		 381 aa  246  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.92 
 
 		 453 aa  247  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2725  hypothetical protein  46.84 
 
 		 499 aa  246  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  37.79 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  41.33 
 
 		 350 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.14 
 
 		 326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1934  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.16 
 
 		 463 aa  245  6e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0560  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.57 
 
 		 506 aa  245  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000445569  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1680  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.68 
 
 		 444 aa  245  6e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.990278  normal  0.232979 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1861  cell division protein FtsY  45.48 
 
 		 465 aa  245  6e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  45.72 
 
 		 451 aa  245  9e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.19 
 
 		 373 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0656  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.11 
 
 		 547 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000419402  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0708  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.41 
 
 		 469 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.85 
 
 		 317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  41 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  44.19 
 
 		 541 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0673  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.08 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0707  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.41 
 
 		 469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  45.39 
 
 		 447 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.14 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.38 
 
 		 491 aa  243  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.98 
 
 		 485 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.98 
 
 		 481 aa  242  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0386  putative cell division protein  44.63 
 
 		 328 aa  242  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.919397 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  43.26 
 
 		 362 aa  242  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3686  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.81 
 
 		 331 aa  242  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.915822  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.33 
 
 		 340 aa  242  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1588  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.16 
 
 		 518 aa  242  7e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.82 
 
 		 320 aa  241  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0651  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.6 
 
 		 320 aa  241  7.999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.85 
 
 		 523 aa  241  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5354  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.92 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  43.85 
 
 		 553 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0390  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.95 
 
 		 524 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4980  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.2 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0017  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.13 
 
 		 387 aa  240  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.278591  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.19 
 
 		 376 aa  240  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.05 
 
 		 540 aa  240  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1050  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.69 
 
 		 326 aa  239  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1714  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.23 
 
 		 304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0632932  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.44 
 
 		 451 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.33 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.28 
 
 		 304 aa  239  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861654 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0573  hypothetical protein  44.65 
 
 		 311 aa  239  5e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0718  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.38 
 
 		 465 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  hitchhiker  0.00719996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0334  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.97 
 
 		 382 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.71 
 
 		 501 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2659  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.72 
 
 		 389 aa  238  8e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319125  hitchhiker  0.000261917 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.18 
 
 		 302 aa  238  9e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.38 
 
 		 611 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.81 
 
 		 329 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.47 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.38 
 
 		 615 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1157  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.89 
 
 		 508 aa  238  1e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000684917  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.06 
 
 		 329 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.38 
 
 		 621 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.33 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>