More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0656 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0656  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 
547 aa  1096    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000419402  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0317  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.63 
 
 
483 aa  598  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2248  signal recognition particle-docking protein FtsY  71.19 
 
 
464 aa  571  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.787704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0560  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.61 
 
 
506 aa  561  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000445569  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1680  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.82 
 
 
444 aa  521  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.990278  normal  0.232979 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0390  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.2 
 
 
524 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.15 
 
 
416 aa  307  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.15 
 
 
416 aa  307  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  46.52 
 
 
408 aa  302  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.87 
 
 
326 aa  299  7e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 
481 aa  295  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  45 
 
 
452 aa  290  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  47.73 
 
 
350 aa  289  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1085  signal recognition particle-docking protein FtsY  51 
 
 
329 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131602  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  47.68 
 
 
305 aa  289  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.56 
 
 
453 aa  288  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.71 
 
 
485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0962  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.92 
 
 
311 aa  287  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000455691  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  47.87 
 
 
362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.39 
 
 
320 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.57 
 
 
501 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.93 
 
 
351 aa  282  9e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  45.51 
 
 
541 aa  282  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.56 
 
 
514 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.34 
 
 
510 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.35 
 
 
309 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.34 
 
 
497 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.34 
 
 
494 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  47 
 
 
340 aa  280  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1976  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.34 
 
 
328 aa  280  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  46.82 
 
 
495 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.3 
 
 
375 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.01 
 
 
432 aa  277  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  46.5 
 
 
471 aa  277  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.43 
 
 
405 aa  277  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.95 
 
 
342 aa  276  6e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.85 
 
 
312 aa  276  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0413  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.01 
 
 
529 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.571496  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  44.72 
 
 
505 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4069  signal recognition particle-docking protein FtsY  48 
 
 
533 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.605645  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  48 
 
 
528 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352146  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.07 
 
 
320 aa  274  3e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.57 
 
 
513 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.28 
 
 
317 aa  273  6e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.82 
 
 
447 aa  273  7e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.77 
 
 
381 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.66 
 
 
320 aa  273  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  48 
 
 
329 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0573  hypothetical protein  44.15 
 
 
311 aa  271  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3686  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.06 
 
 
331 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.915822  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4328  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.62 
 
 
413 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2442  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.52 
 
 
310 aa  271  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000126668  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1921  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.28 
 
 
346 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0684564 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  46.89 
 
 
408 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1715  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.54 
 
 
319 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1934  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.51 
 
 
463 aa  270  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1861  cell division protein FtsY  46.51 
 
 
465 aa  270  5e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.229627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.67 
 
 
329 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  47.67 
 
 
329 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0925  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.85 
 
 
494 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.67 
 
 
329 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.67 
 
 
329 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1843  Signal recognition particle-docking protein FtsY  51.47 
 
 
393 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.33 
 
 
329 aa  269  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  47.67 
 
 
329 aa  269  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0632  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.1 
 
 
410 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255815  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.67 
 
 
329 aa  269  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0492  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.47 
 
 
379 aa  269  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0977518  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.33 
 
 
329 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4411  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.49 
 
 
437 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.04 
 
 
482 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1214  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.37 
 
 
381 aa  268  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.67 
 
 
329 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.75 
 
 
451 aa  267  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.33 
 
 
329 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3410  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.71 
 
 
473 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.457129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.39 
 
 
611 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5338  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.08 
 
 
466 aa  266  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.870799  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  47.87 
 
 
563 aa  266  8e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.39 
 
 
615 aa  266  8e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.39 
 
 
621 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.59 
 
 
373 aa  265  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3091  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.85 
 
 
520 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.694563 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0718  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.51 
 
 
465 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  hitchhiker  0.00719996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1386  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.96 
 
 
348 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.478265  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.39 
 
 
540 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2901  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.67 
 
 
330 aa  265  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0317002 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.11 
 
 
535 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1400  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.83 
 
 
308 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324422  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.82 
 
 
386 aa  265  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104653  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2732  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.33 
 
 
308 aa  265  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3389  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.16 
 
 
500 aa  265  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2659  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.08 
 
 
389 aa  265  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319125  hitchhiker  0.000261917 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3297  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.85 
 
 
409 aa  265  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10090  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.55 
 
 
304 aa  264  3e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.653732  hitchhiker  0.000000602887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  47.17 
 
 
491 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1157  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.77 
 
 
508 aa  264  3e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000684917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.02 
 
 
515 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0850  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.11 
 
 
301 aa  264  3e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.261607 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.54 
 
 
387 aa  264  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>