More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0777 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  100 
 
 		 305 aa  604  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  60 
 
 		 312 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.52 
 
 		 340 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.52 
 
 		 351 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  56.19 
 
 		 350 aa  346  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  54.49 
 
 		 408 aa  346  3e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.8 
 
 		 310 aa  345  5e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.62 
 
 		 309 aa  342  4e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.49 
 
 		 416 aa  342  4e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.49 
 
 		 416 aa  342  4e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.44 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1085  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.28 
 
 		 329 aa  338  7e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.85 
 
 		 342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.11 
 
 		 329 aa  332  5e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.11 
 
 		 329 aa  331  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.11 
 
 		 329 aa  330  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0962  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.41 
 
 		 311 aa  329  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000455691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.11 
 
 		 329 aa  329  3e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1715  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.19 
 
 		 319 aa  328  8e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.45 
 
 		 329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.45 
 
 		 329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  55.45 
 
 		 329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.45 
 
 		 329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.45 
 
 		 329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  55.45 
 
 		 329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1976  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.57 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3317  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.52 
 
 		 381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00314422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.45 
 
 		 329 aa  325  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3297  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.18 
 
 		 409 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0646  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.48 
 
 		 304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.124124  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0964  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.85 
 
 		 409 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0490186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.84 
 
 		 326 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.47 
 
 		 320 aa  316  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2354  cell division membrane protein  52.98 
 
 		 472 aa  315  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000763762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.67 
 
 		 302 aa  314  9e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3090  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.66 
 
 		 320 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.0202062 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  57 
 
 		 302 aa  311  6.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.33 
 
 		 481 aa  311  6.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.18 
 
 		 301 aa  310  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.85 
 
 		 317 aa  309  4e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  50.5 
 
 		 495 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4980  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 		 317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.51 
 
 		 485 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 		 320 aa  305  9.000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  49.83 
 
 		 471 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.16 
 
 		 381 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.83 
 
 		 432 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2442  signal recognition particle-docking protein FtsY  52 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000126668  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07270  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.85 
 
 		 322 aa  300  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000016594  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 		 452 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.33 
 
 		 453 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.67 
 
 		 320 aa  299  4e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 		 373 aa  299  4e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0651  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.34 
 
 		 320 aa  299  5e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0619  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.68 
 
 		 347 aa  298  7e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124261  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  49.17 
 
 		 317 aa  297  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1687  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.85 
 
 		 304 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000444136  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1212  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  51.31 
 
 		 317 aa  296  3e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0276654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1969  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.51 
 
 		 304 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 562 aa  296  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  47 
 
 		 405 aa  296  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0337  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 316 aa  295  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124726  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.51 
 
 		 584 aa  295  7e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.34 
 
 		 320 aa  295  8e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.82 
 
 		 643 aa  294  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 		 494 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  47.54 
 
 		 541 aa  293  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.51 
 
 		 482 aa  293  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2611  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.47 
 
 		 317 aa  293  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0317  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.84 
 
 		 483 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.06 
 
 		 501 aa  293  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  51.17 
 
 		 491 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  51.17 
 
 		 491 aa  292  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  51.17 
 
 		 491 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0958  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.17 
 
 		 400 aa  292  6e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 		 540 aa  292  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1050  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 		 326 aa  292  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 		 514 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  49.18 
 
 		 510 aa  291  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.85 
 
 		 615 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.85 
 
 		 621 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.17 
 
 		 497 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3476  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.17 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000916186  decreased coverage  0.000245691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.51 
 
 		 582 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.85 
 
 		 540 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.85 
 
 		 611 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.84 
 
 		 510 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0333  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  50.5 
 
 		 497 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0259  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 		 317 aa  290  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0102386  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  50.5 
 
 		 498 aa  289  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  50.84 
 
 		 491 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  50.5 
 
 		 498 aa  289  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  50.5 
 
 		 511 aa  290  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  50.5 
 
 		 498 aa  289  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 		 497 aa  289  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  50.5 
 
 		 498 aa  289  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  50.5 
 
 		 512 aa  289  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  50.84 
 
 		 491 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  50.5 
 
 		 498 aa  289  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>