More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0259 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0259  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 317 aa  637    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0102386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0337  signal recognition particle-docking protein FtsY  89.56 
 
 		 316 aa  555  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124726  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2611  signal recognition particle-docking protein FtsY  88.25 
 
 		 317 aa  546  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1212  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  85.49 
 
 		 317 aa  536  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0276654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1925  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  81.07 
 
 		 317 aa  508  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0333  signal recognition particle-docking protein FtsY  79.3 
 
 		 315 aa  498  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0359  signal recognition particle-docking protein FtsY  78.03 
 
 		 314 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000537839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.64 
 
 		 320 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3090  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.56 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.0202062 
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.87 
 
 		 317 aa  364  1e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.49 
 
 		 320 aa  360  1e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0651  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.77 
 
 		 320 aa  349  4e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4980  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.33 
 
 		 317 aa  348  6e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  55.02 
 
 		 317 aa  344  1e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5354  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.17 
 
 		 318 aa  337  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.04 
 
 		 320 aa  333  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3607  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.77 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  52.82 
 
 		 350 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.74 
 
 		 309 aa  318  7e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 		 326 aa  316  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.16 
 
 		 405 aa  315  8e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 		 340 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.56 
 
 		 375 aa  312  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.63 
 
 		 501 aa  312  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.83 
 
 		 351 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  50.32 
 
 		 305 aa  311  7.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.83 
 
 		 373 aa  310  1e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.32 
 
 		 453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0573  hypothetical protein  49.2 
 
 		 311 aa  309  2.9999999999999997e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.04 
 
 		 485 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.83 
 
 		 342 aa  308  9e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.61 
 
 		 494 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.73 
 
 		 481 aa  306  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.61 
 
 		 510 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.61 
 
 		 497 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.48 
 
 		 514 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.57 
 
 		 312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  50 
 
 		 362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.68 
 
 		 416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.68 
 
 		 416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.53 
 
 		 320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  50.32 
 
 		 541 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.1 
 
 		 310 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.68 
 
 		 513 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 		 452 aa  302  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  49.68 
 
 		 505 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  47.7 
 
 		 408 aa  301  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 		 432 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.32 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1544  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.02 
 
 		 391 aa  296  3e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  49.04 
 
 		 495 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.45 
 
 		 302 aa  296  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.56 
 
 		 301 aa  296  4e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  49.04 
 
 		 471 aa  295  6e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.28 
 
 		 295 aa  295  8e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.39 
 
 		 397 aa  295  9e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  50 
 
 		 497 aa  294  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  50 
 
 		 408 aa  294  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2442  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.94 
 
 		 310 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000126668  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  49.68 
 
 		 498 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  49.68 
 
 		 498 aa  293  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0646  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.04 
 
 		 304 aa  293  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.124124  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  49.68 
 
 		 498 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  49.68 
 
 		 498 aa  293  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  49.68 
 
 		 512 aa  293  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  49.68 
 
 		 498 aa  293  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  49.04 
 
 		 511 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.94 
 
 		 451 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.68 
 
 		 477 aa  293  4e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.49 
 
 		 643 aa  292  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.83 
 
 		 329 aa  292  5e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  47.83 
 
 		 329 aa  292  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.83 
 
 		 329 aa  292  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.83 
 
 		 329 aa  292  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  49.36 
 
 		 491 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.73 
 
 		 540 aa  292  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  49.36 
 
 		 491 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.36 
 
 		 497 aa  292  6e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  49.36 
 
 		 491 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  49.68 
 
 		 497 aa  291  7e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 		 535 aa  291  7e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.67 
 
 		 320 aa  291  8e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.68 
 
 		 387 aa  291  8e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 302 aa  291  9e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.83 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.67 
 
 		 584 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0718  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.83 
 
 		 465 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  hitchhiker  0.00719996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  49.36 
 
 		 491 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.35 
 
 		 562 aa  290  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.52 
 
 		 329 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  49.04 
 
 		 491 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.34 
 
 		 478 aa  290  3e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.67 
 
 		 329 aa  290  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.83 
 
 		 329 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  47.52 
 
 		 329 aa  289  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.04 
 
 		 491 aa  289  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.52 
 
 		 329 aa  289  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  51.58 
 
 		 447 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.12 
 
 		 561 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.5 
 
 		 376 aa  288  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>