More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4980 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4980  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 
317 aa  634    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  81.7 
 
 
320 aa  535  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  82.65 
 
 
317 aa  529  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  73.42 
 
 
317 aa  478  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3090  signal recognition particle-docking protein FtsY  71.2 
 
 
320 aa  474  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.0202062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5354  signal recognition particle-docking protein FtsY  72.33 
 
 
318 aa  460  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  72.93 
 
 
320 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0651  signal recognition particle-docking protein FtsY  70.75 
 
 
320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3607  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.63 
 
 
320 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.71 
 
 
320 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0573  hypothetical protein  58.68 
 
 
311 aa  384  1e-106  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2611  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.75 
 
 
317 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1212  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  54.11 
 
 
317 aa  331  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0276654  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0337  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.53 
 
 
316 aa  328  9e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124726  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0259  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.33 
 
 
317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0102386  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1925  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  52.53 
 
 
317 aa  324  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0333  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.53 
 
 
315 aa  323  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.84 
 
 
326 aa  323  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.99 
 
 
351 aa  322  7e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  49.01 
 
 
350 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0708  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.64 
 
 
469 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0707  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.64 
 
 
469 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0359  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.22 
 
 
314 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000537839  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0673  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.82 
 
 
444 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.52 
 
 
340 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.34 
 
 
310 aa  309  4e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  49.5 
 
 
305 aa  307  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0718  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.32 
 
 
465 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  hitchhiker  0.00719996 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.99 
 
 
405 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.7 
 
 
342 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.28 
 
 
373 aa  302  6.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.17 
 
 
514 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.49 
 
 
320 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.83 
 
 
510 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.16 
 
 
432 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 
497 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 
494 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.53 
 
 
312 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.19 
 
 
453 aa  298  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 
485 aa  297  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  49.5 
 
 
505 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 
513 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  51.5 
 
 
471 aa  293  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  51.5 
 
 
495 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 
451 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.17 
 
 
452 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.17 
 
 
481 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.67 
 
 
381 aa  289  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.16 
 
 
416 aa  289  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.16 
 
 
416 aa  289  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  50.17 
 
 
408 aa  289  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  48.01 
 
 
541 aa  289  5.0000000000000004e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.42 
 
 
309 aa  288  7e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 
375 aa  288  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.49 
 
 
501 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.87 
 
 
387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.16 
 
 
515 aa  285  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  46.03 
 
 
362 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  53.26 
 
 
407 aa  285  7e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  46.82 
 
 
408 aa  285  9e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  50.66 
 
 
563 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 
562 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.83 
 
 
447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 
584 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.05 
 
 
302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  50.5 
 
 
511 aa  283  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  50.5 
 
 
491 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01431  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.29 
 
 
311 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15526  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 
582 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.99 
 
 
523 aa  282  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  50.99 
 
 
553 aa  282  5.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  48.16 
 
 
355 aa  281  7.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  50.99 
 
 
541 aa  282  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.2 
 
 
329 aa  281  9e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.69 
 
 
329 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  47.69 
 
 
329 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.69 
 
 
329 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.69 
 
 
329 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  50.17 
 
 
451 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3317  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.36 
 
 
381 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00314422  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  50.5 
 
 
491 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0619  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.95 
 
 
347 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124261  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  50.5 
 
 
491 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1715  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.7 
 
 
319 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3297  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.7 
 
 
409 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  49.83 
 
 
447 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.2 
 
 
329 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.89 
 
 
329 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  50.5 
 
 
491 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.83 
 
 
497 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  49.83 
 
 
497 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  49.83 
 
 
512 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  49.83 
 
 
498 aa  279  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  47.49 
 
 
355 aa  279  4e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  49.83 
 
 
498 aa  279  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  49.83 
 
 
498 aa  279  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  49.83 
 
 
498 aa  279  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  49.83 
 
 
498 aa  279  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.38 
 
 
329 aa  279  5e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  48.42 
 
 
510 aa  278  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>