More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0651 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0651  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 320 aa  643    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5354  signal recognition particle-docking protein FtsY  75.79 
 
 		 318 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3607  signal recognition particle-docking protein FtsY  72.87 
 
 		 320 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.94 
 
 		 317 aa  452  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4980  signal recognition particle-docking protein FtsY  70.75 
 
 		 317 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.84 
 
 		 320 aa  450  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  70.22 
 
 		 317 aa  440  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3090  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.14 
 
 		 320 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.0202062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.98 
 
 		 320 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0573  hypothetical protein  60.69 
 
 		 311 aa  414  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.34 
 
 		 320 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.11 
 
 		 351 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  51.8 
 
 		 350 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2611  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.87 
 
 		 317 aa  331  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0333  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.4 
 
 		 315 aa  330  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0259  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.41 
 
 		 317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0102386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0337  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.59 
 
 		 316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124726  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.77 
 
 		 342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1212  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  55.91 
 
 		 317 aa  326  3e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0276654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1925  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  54.31 
 
 		 317 aa  322  5e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0359  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.7 
 
 		 314 aa  319  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000537839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 340 aa  318  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 326 aa  317  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0718  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.31 
 
 		 465 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  hitchhiker  0.00719996 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0673  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 444 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0708  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.65 
 
 		 469 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0707  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.65 
 
 		 469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.22 
 
 		 373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.66 
 
 		 381 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 		 510 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  49.34 
 
 		 305 aa  299  5e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 514 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 		 497 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.68 
 
 		 494 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3317  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.13 
 
 		 381 aa  296  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00314422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3297  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.8 
 
 		 409 aa  295  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3700  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.05 
 
 		 377 aa  295  7e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0964  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.48 
 
 		 409 aa  294  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0490186  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.68 
 
 		 584 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.36 
 
 		 562 aa  294  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 		 320 aa  293  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.78 
 
 		 453 aa  293  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  48.87 
 
 		 541 aa  292  6e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  49.68 
 
 		 510 aa  291  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.7 
 
 		 501 aa  292  7e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 		 432 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.54 
 
 		 452 aa  289  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.65 
 
 		 310 aa  289  5.0000000000000004e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2354  cell division membrane protein  49.67 
 
 		 472 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000763762  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.14 
 
 		 375 aa  289  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 301 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.04 
 
 		 582 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1050  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.52 
 
 		 326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  47.83 
 
 		 408 aa  288  6e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.43 
 
 		 513 aa  288  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  48.43 
 
 		 505 aa  288  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 312 aa  288  9e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  49.84 
 
 		 563 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.15 
 
 		 485 aa  287  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.65 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.36 
 
 		 451 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.67 
 
 		 482 aa  286  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  48.54 
 
 		 471 aa  285  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  49.2 
 
 		 495 aa  285  7e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2901  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.02 
 
 		 330 aa  285  8e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0317002 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.28 
 
 		 309 aa  285  8e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.49 
 
 		 416 aa  285  9e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.49 
 
 		 416 aa  285  9e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.34 
 
 		 611 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.34 
 
 		 621 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.6 
 
 		 481 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.39 
 
 		 329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.34 
 
 		 540 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.34 
 
 		 615 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  50 
 
 		 408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.57 
 
 		 405 aa  281  7.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 		 475 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  50.16 
 
 		 447 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.23 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  47.37 
 
 		 355 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2903  cell division protein FtsY  51.28 
 
 		 410 aa  280  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297557  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3476  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.52 
 
 		 326 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000916186  decreased coverage  0.000245691 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.94 
 
 		 643 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.85 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.57 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  47.04 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.92 
 
 		 302 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 		 447 aa  280  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  49.84 
 
 		 451 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  45.23 
 
 		 329 aa  279  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.85 
 
 		 329 aa  279  5e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.01 
 
 		 487 aa  279  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.6 
 
 		 302 aa  279  5e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.85 
 
 		 329 aa  279  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.27 
 
 		 561 aa  278  7e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.27 
 
 		 491 aa  278  7e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0962  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.96 
 
 		 311 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000455691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01431  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.51 
 
 		 311 aa  277  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15526  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 587 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>