More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0333 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0333  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 
315 aa  639    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0359  signal recognition particle-docking protein FtsY  85.03 
 
 
314 aa  532  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000537839  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1212  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  80.57 
 
 
317 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0276654  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0337  signal recognition particle-docking protein FtsY  79.62 
 
 
316 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124726  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0259  signal recognition particle-docking protein FtsY  79.3 
 
 
317 aa  498  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0102386  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2611  signal recognition particle-docking protein FtsY  78.66 
 
 
317 aa  498  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1925  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  77.71 
 
 
317 aa  480  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.99 
 
 
320 aa  388  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.73 
 
 
317 aa  362  4e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3090  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.06 
 
 
320 aa  362  6e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.0202062 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.02 
 
 
320 aa  352  4e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0651  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.4 
 
 
320 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4980  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.53 
 
 
317 aa  345  7e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5354  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.03 
 
 
318 aa  343  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  53.55 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3607  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.77 
 
 
320 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.62 
 
 
320 aa  323  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.8 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  52.3 
 
 
350 aa  316  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.78 
 
 
373 aa  316  4e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.92 
 
 
351 aa  315  7e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.68 
 
 
453 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  50.16 
 
 
305 aa  312  4.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 
309 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.4 
 
 
452 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0573  hypothetical protein  47.77 
 
 
311 aa  310  2e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  50.66 
 
 
362 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.49 
 
 
501 aa  308  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.52 
 
 
340 aa  308  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.36 
 
 
481 aa  308  5.9999999999999995e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.08 
 
 
432 aa  308  8e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.97 
 
 
405 aa  305  5.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.48 
 
 
510 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.48 
 
 
494 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.89 
 
 
485 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.48 
 
 
514 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  47.52 
 
 
408 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.48 
 
 
497 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 
397 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.3 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.52 
 
 
375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  50.16 
 
 
541 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  50 
 
 
505 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 
513 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.2 
 
 
310 aa  301  8.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  51.12 
 
 
495 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 
342 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0646  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.04 
 
 
304 aa  300  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.124124  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  50.8 
 
 
471 aa  299  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.48 
 
 
312 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.86 
 
 
416 aa  298  7e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.86 
 
 
416 aa  298  7e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.44 
 
 
584 aa  298  8e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.12 
 
 
562 aa  296  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.61 
 
 
482 aa  296  4e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 
477 aa  296  4e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  52.44 
 
 
510 aa  295  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.42 
 
 
540 aa  295  6e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  49.67 
 
 
355 aa  295  9e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  50.8 
 
 
497 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  50.8 
 
 
498 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.8 
 
 
497 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.44 
 
 
535 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.2 
 
 
381 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  50.8 
 
 
498 aa  293  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  50.8 
 
 
512 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  50.8 
 
 
498 aa  293  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  50.8 
 
 
498 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  50.8 
 
 
498 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.79 
 
 
582 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  50.48 
 
 
491 aa  292  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  49.01 
 
 
355 aa  292  4e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  51.41 
 
 
563 aa  292  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  50.48 
 
 
491 aa  292  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 
320 aa  292  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.36 
 
 
302 aa  292  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.28 
 
 
491 aa  292  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  50.48 
 
 
491 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.65 
 
 
611 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  50.8 
 
 
497 aa  292  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  50.48 
 
 
491 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.65 
 
 
621 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.35 
 
 
478 aa  291  8e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  49.84 
 
 
511 aa  291  8e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.65 
 
 
615 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.65 
 
 
540 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  50.65 
 
 
408 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  51.44 
 
 
541 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 
643 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.69 
 
 
329 aa  290  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.8 
 
 
301 aa  290  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.68 
 
 
302 aa  290  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0216  cell division protein  49.01 
 
 
324 aa  290  3e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.345429  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  50.16 
 
 
491 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.99 
 
 
487 aa  290  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.31 
 
 
329 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 
587 aa  290  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 
561 aa  289  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.69 
 
 
329 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2442  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 
310 aa  289  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000126668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>