More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3607 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3607  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 320 aa  639    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5354  signal recognition particle-docking protein FtsY  79.87 
 
 		 318 aa  518  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0651  signal recognition particle-docking protein FtsY  72.87 
 
 		 320 aa  479  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  70.89 
 
 		 317 aa  468  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.99 
 
 		 320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  68.24 
 
 		 317 aa  445  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4980  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.63 
 
 		 317 aa  441  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.67 
 
 		 320 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3090  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.25 
 
 		 320 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.0202062 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0573  hypothetical protein  60.69 
 
 		 311 aa  411  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.06 
 
 		 320 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.75 
 
 		 351 aa  340  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2611  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.51 
 
 		 317 aa  338  8e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  52.94 
 
 		 350 aa  334  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0337  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.72 
 
 		 316 aa  332  5e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124726  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.92 
 
 		 326 aa  332  6e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0259  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.77 
 
 		 317 aa  331  9e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0102386  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0333  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.77 
 
 		 315 aa  329  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1212  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  55.24 
 
 		 317 aa  326  3e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0276654  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.29 
 
 		 342 aa  322  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.2 
 
 		 340 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0359  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.7 
 
 		 314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000537839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1925  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  51.58 
 
 		 317 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0708  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.2 
 
 		 469 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0707  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.2 
 
 		 469 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0673  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.87 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.55 
 
 		 320 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3317  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.23 
 
 		 381 aa  302  6.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00314422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.21 
 
 		 513 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  49.21 
 
 		 505 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0718  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.36 
 
 		 465 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  hitchhiker  0.00719996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.08 
 
 		 514 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.08 
 
 		 510 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.08 
 
 		 494 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.08 
 
 		 497 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0964  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.31 
 
 		 409 aa  295  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0490186  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.76 
 
 		 373 aa  294  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3700  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.68 
 
 		 377 aa  293  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3297  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.65 
 
 		 409 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.69 
 
 		 485 aa  292  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.52 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.58 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  46.73 
 
 		 305 aa  289  4e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  47.47 
 
 		 541 aa  288  6e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.12 
 
 		 381 aa  288  8e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.57 
 
 		 309 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1050  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.87 
 
 		 326 aa  287  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.69 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.72 
 
 		 432 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  46.2 
 
 		 408 aa  285  5e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.4 
 
 		 453 aa  285  5e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.36 
 
 		 451 aa  285  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2354  cell division membrane protein  48.09 
 
 		 472 aa  285  8e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000763762  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.2 
 
 		 416 aa  284  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.2 
 
 		 416 aa  284  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.2 
 
 		 302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.36 
 
 		 295 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 		 302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.71 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  48.09 
 
 		 408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.23 
 
 		 329 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.12 
 
 		 452 aa  281  9e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.72 
 
 		 515 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.89 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.36 
 
 		 387 aa  281  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  48.4 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.77 
 
 		 562 aa  279  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3476  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.91 
 
 		 326 aa  278  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000916186  decreased coverage  0.000245691 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  46.03 
 
 		 362 aa  278  7e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  47.1 
 
 		 510 aa  277  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2901  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.15 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0317002 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.93 
 
 		 584 aa  277  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.03 
 
 		 481 aa  277  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  47.76 
 
 		 495 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.97 
 
 		 501 aa  276  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  47.76 
 
 		 447 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.25 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.08 
 
 		 335 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0216  cell division protein  47.54 
 
 		 324 aa  276  4e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.345429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.25 
 
 		 329 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.25 
 
 		 329 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  46.25 
 
 		 329 aa  276  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  47.84 
 
 		 355 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  48.17 
 
 		 355 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.25 
 
 		 329 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.25 
 
 		 329 aa  275  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  47.44 
 
 		 451 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  47.77 
 
 		 563 aa  275  9e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2108  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.21 
 
 		 324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.15 
 
 		 329 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0776  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.48 
 
 		 314 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.02 
 
 		 643 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  50.76 
 
 		 407 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01431  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.6 
 
 		 311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15526  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.93 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  45.93 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.6 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.37 
 
 		 397 aa  273  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2903  cell division protein FtsY  49.21 
 
 		 410 aa  273  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.24 
 
 		 475 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>