More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0359 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0359  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 314 aa  635    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000537839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0333  signal recognition particle-docking protein FtsY  85.03 
 
 		 315 aa  532  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0259  signal recognition particle-docking protein FtsY  78.03 
 
 		 317 aa  490  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0102386  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1212  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  78.03 
 
 		 317 aa  486  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0276654  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2611  signal recognition particle-docking protein FtsY  75.8 
 
 		 317 aa  479  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0337  signal recognition particle-docking protein FtsY  75.48 
 
 		 316 aa  479  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124726  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1925  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  74.52 
 
 		 317 aa  464  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.04 
 
 		 320 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3090  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.11 
 
 		 320 aa  358  7e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.0202062 
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.14 
 
 		 317 aa  356  2.9999999999999997e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.72 
 
 		 320 aa  342  5e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4980  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.22 
 
 		 317 aa  340  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0651  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.7 
 
 		 320 aa  341  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5354  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.46 
 
 		 318 aa  338  7e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  52.9 
 
 		 317 aa  332  7.000000000000001e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3607  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.66 
 
 		 320 aa  318  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.69 
 
 		 320 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.31 
 
 		 373 aa  314  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  51.32 
 
 		 350 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.27 
 
 		 309 aa  309  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.48 
 
 		 514 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.48 
 
 		 510 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 		 351 aa  305  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 494 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.52 
 
 		 375 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.02 
 
 		 326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 		 513 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  50.32 
 
 		 505 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.77 
 
 		 453 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 497 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0573  hypothetical protein  47.13 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.32 
 
 		 405 aa  302  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.87 
 
 		 340 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.8 
 
 		 432 aa  302  6.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 452 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.59 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.86 
 
 		 501 aa  300  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.77 
 
 		 481 aa  298  6e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  48.53 
 
 		 305 aa  298  7e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  49.01 
 
 		 362 aa  297  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.87 
 
 		 397 aa  296  4e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.48 
 
 		 312 aa  295  6e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0646  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.08 
 
 		 304 aa  295  7e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.124124  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  50.63 
 
 		 563 aa  293  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.5 
 
 		 485 aa  292  5e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  47.71 
 
 		 541 aa  291  8e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  49.2 
 
 		 495 aa  291  9e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.54 
 
 		 477 aa  291  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.22 
 
 		 478 aa  290  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.48 
 
 		 515 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  48.88 
 
 		 471 aa  289  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1921  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.41 
 
 		 346 aa  288  8e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0684564 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 		 320 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.37 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  46.2 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 584 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  51.27 
 
 		 451 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.04 
 
 		 302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.19 
 
 		 643 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 451 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  50.96 
 
 		 447 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 		 582 aa  286  5e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 		 562 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.07 
 
 		 416 aa  285  8e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.07 
 
 		 416 aa  285  8e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.04 
 
 		 540 aa  285  9e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  50.16 
 
 		 541 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.04 
 
 		 491 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.03 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  49.84 
 
 		 510 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  48.69 
 
 		 408 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.67 
 
 		 487 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.52 
 
 		 535 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  48.56 
 
 		 497 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.69 
 
 		 387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 		 523 aa  282  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  49.84 
 
 		 553 aa  282  4.0000000000000003e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  48.56 
 
 		 498 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  48.56 
 
 		 498 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  48.56 
 
 		 498 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  48.56 
 
 		 498 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  48.56 
 
 		 491 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  48.56 
 
 		 498 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.18 
 
 		 381 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.88 
 
 		 497 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  48.56 
 
 		 491 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.87 
 
 		 447 aa  281  7.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  48.56 
 
 		 512 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  48.56 
 
 		 491 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  48.56 
 
 		 491 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2901  signal recognition particle-docking protein FtsY  49 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0317002 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.44 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  46.44 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  48.56 
 
 		 497 aa  280  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.44 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.48 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.46 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.17 
 
 		 386 aa  280  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104653  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  47.92 
 
 		 511 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>