More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1212 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1212  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  100 
 
 		 317 aa  639    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0276654  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2611  signal recognition particle-docking protein FtsY  89.59 
 
 		 317 aa  559  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0259  signal recognition particle-docking protein FtsY  85.49 
 
 		 317 aa  536  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0102386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0337  signal recognition particle-docking protein FtsY  85.44 
 
 		 316 aa  534  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124726  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1925  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  84.54 
 
 		 317 aa  527  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0333  signal recognition particle-docking protein FtsY  80.57 
 
 		 315 aa  506  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0359  signal recognition particle-docking protein FtsY  78.03 
 
 		 314 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000537839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.89 
 
 		 320 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.05 
 
 		 317 aa  362  6e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.63 
 
 		 320 aa  359  3e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3090  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.06 
 
 		 320 aa  359  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.0202062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4980  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.11 
 
 		 317 aa  352  4e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0651  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.91 
 
 		 320 aa  348  8e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  55.16 
 
 		 317 aa  341  8e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5354  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.72 
 
 		 318 aa  335  7e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.5 
 
 		 320 aa  332  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3607  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.24 
 
 		 320 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  51.31 
 
 		 305 aa  318  9e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.97 
 
 		 351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  52.63 
 
 		 350 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 453 aa  312  3.9999999999999997e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.64 
 
 		 309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.52 
 
 		 340 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.11 
 
 		 494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.11 
 
 		 514 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.97 
 
 		 405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.1 
 
 		 513 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  51.1 
 
 		 505 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.11 
 
 		 510 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.03 
 
 		 326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.11 
 
 		 497 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.36 
 
 		 481 aa  302  5.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0573  hypothetical protein  48.09 
 
 		 311 aa  302  5.000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 501 aa  301  7.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.72 
 
 		 375 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 373 aa  300  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.99 
 
 		 342 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  50.48 
 
 		 541 aa  295  5e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.12 
 
 		 312 aa  295  6e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.89 
 
 		 397 aa  295  7e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.13 
 
 		 562 aa  295  8e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  46.05 
 
 		 408 aa  295  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.31 
 
 		 452 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.48 
 
 		 485 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.28 
 
 		 584 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1921  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.9 
 
 		 346 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0684564 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.26 
 
 		 477 aa  293  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1544  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.73 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  51.45 
 
 		 510 aa  292  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  48.69 
 
 		 362 aa  292  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 		 320 aa  292  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.13 
 
 		 329 aa  292  6e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.69 
 
 		 540 aa  291  7e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.09 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.02 
 
 		 451 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 432 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1715  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.62 
 
 		 319 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.68 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.28 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.4 
 
 		 301 aa  290  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.64 
 
 		 582 aa  289  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1050  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.04 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.52 
 
 		 491 aa  290  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  49.37 
 
 		 495 aa  289  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0646  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.04 
 
 		 304 aa  288  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.124124  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.32 
 
 		 478 aa  288  8e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2901  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.67 
 
 		 330 aa  288  8e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0317002 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 376 aa  288  9e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.74 
 
 		 416 aa  288  9e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.74 
 
 		 416 aa  288  9e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  50.16 
 
 		 491 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  50.16 
 
 		 491 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  50.16 
 
 		 491 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0216  cell division protein  49.01 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.345429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 		 482 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  49.21 
 
 		 511 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.38 
 
 		 561 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3476  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.83 
 
 		 326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000916186  decreased coverage  0.000245691 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.51 
 
 		 386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104653  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  49.68 
 
 		 563 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  50 
 
 		 497 aa  285  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  48.74 
 
 		 471 aa  286  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2108  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.68 
 
 		 324 aa  285  5e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  50 
 
 		 498 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  50 
 
 		 498 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  50 
 
 		 498 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  50 
 
 		 498 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2442  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.63 
 
 		 310 aa  285  5.999999999999999e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000126668  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  50 
 
 		 498 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 497 aa  285  7e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  50 
 
 		 512 aa  285  7e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.48 
 
 		 487 aa  285  8e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  49.84 
 
 		 491 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.68 
 
 		 643 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1714  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.58 
 
 		 304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0632932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.63 
 
 		 515 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0962  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.6 
 
 		 311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000455691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  49.52 
 
 		 491 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.77 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>