More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1050 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1050  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 326 aa  657    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3476  signal recognition particle-docking protein FtsY  94.17 
 
 		 326 aa  622  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000916186  decreased coverage  0.000245691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2901  signal recognition particle-docking protein FtsY  74.3 
 
 		 330 aa  480  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0317002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4162  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.36 
 
 		 321 aa  349  4e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  49.5 
 
 		 305 aa  292  6e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.69 
 
 		 320 aa  291  9e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0651  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.52 
 
 		 320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  48.14 
 
 		 408 aa  287  1e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  46.51 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.29 
 
 		 320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.37 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0776  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.19 
 
 		 314 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.28 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.28 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3090  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.03 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.0202062 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.68 
 
 		 485 aa  279  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.67 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.83 
 
 		 514 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.83 
 
 		 351 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.83 
 
 		 497 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.01 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.28 
 
 		 453 aa  276  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.35 
 
 		 373 aa  276  4e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.83 
 
 		 494 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  49.17 
 
 		 505 aa  275  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.17 
 
 		 513 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.83 
 
 		 510 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.14 
 
 		 302 aa  273  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.77 
 
 		 320 aa  272  6e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.39 
 
 		 326 aa  271  8.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0573  hypothetical protein  44.59 
 
 		 311 aa  271  9e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.85 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  44.85 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.85 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.85 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  44.85 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  45.65 
 
 		 541 aa  270  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.58 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.18 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 515 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1212  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  48.04 
 
 		 317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0276654  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.17 
 
 		 329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.07 
 
 		 329 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.82 
 
 		 329 aa  269  4e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5354  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.27 
 
 		 318 aa  269  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.55 
 
 		 329 aa  269  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4980  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.34 
 
 		 317 aa  269  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.15 
 
 		 329 aa  269  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.68 
 
 		 329 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2611  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.91 
 
 		 317 aa  267  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  39.82 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.51 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0619  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.37 
 
 		 347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1976  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.67 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0216  cell division protein  43.11 
 
 		 324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.345429  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3607  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.87 
 
 		 320 aa  265  5.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.17 
 
 		 310 aa  265  5.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.17 
 
 		 432 aa  265  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.39 
 
 		 501 aa  265  7e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.02 
 
 		 481 aa  265  8e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0337  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.18 
 
 		 316 aa  265  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124726  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1715  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.43 
 
 		 319 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.32 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2108  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.81 
 
 		 324 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  47 
 
 		 309 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1085  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.12 
 
 		 329 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.31 
 
 		 342 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.2 
 
 		 397 aa  263  3e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.25 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0317  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.32 
 
 		 483 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  46.58 
 
 		 408 aa  262  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0170  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.12 
 
 		 347 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.200798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  47.84 
 
 		 471 aa  260  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0333  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.81 
 
 		 315 aa  260  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0673  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.93 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191674  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  47.84 
 
 		 495 aa  259  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2305  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 315 aa  258  7e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  47.14 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.26 
 
 		 477 aa  258  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  46.58 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0259  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.03 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0102386  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3686  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.16 
 
 		 331 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.915822  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 451 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3317  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.49 
 
 		 381 aa  256  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00314422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  52.09 
 
 		 451 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2442  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.26 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000126668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0708  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.93 
 
 		 469 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  46.8 
 
 		 355 aa  255  6e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0560  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.33 
 
 		 506 aa  255  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000445569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0707  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.27 
 
 		 469 aa  255  7e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  51.71 
 
 		 447 aa  255  8e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0646  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.17 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.124124  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0718  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.44 
 
 		 465 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  hitchhiker  0.00719996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4328  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.14 
 
 		 413 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1157  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.65 
 
 		 508 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000684917  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.68 
 
 		 478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2354  cell division membrane protein  47.68 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000763762  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1925  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  46.08 
 
 		 317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.94 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.83 
 
 		 475 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>