More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1555 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 295 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1768  signal recognition particle-docking protein FtsY  70.95 
 
 		 304 aa  409  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00021093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0366  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.6 
 
 		 294 aa  374  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0348  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.58 
 
 		 294 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207618  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1714  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.73 
 
 		 304 aa  326  4.0000000000000003e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0632932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.66 
 
 		 351 aa  314  9e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  51.99 
 
 		 350 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.15 
 
 		 320 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  52.49 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.32 
 
 		 342 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.66 
 
 		 340 aa  306  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.47 
 
 		 373 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.64 
 
 		 405 aa  305  7e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.33 
 
 		 326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.32 
 
 		 481 aa  300  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.97 
 
 		 501 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  51.49 
 
 		 495 aa  299  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.15 
 
 		 302 aa  298  7e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.16 
 
 		 432 aa  298  8e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 		 320 aa  297  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  50.83 
 
 		 471 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.66 
 
 		 309 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  51.49 
 
 		 505 aa  295  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.32 
 
 		 452 aa  295  6e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.49 
 
 		 513 aa  295  7e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.8 
 
 		 312 aa  295  7e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.81 
 
 		 561 aa  295  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1715  signal recognition particle-docking protein FtsY  55 
 
 		 319 aa  295  8e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 453 aa  294  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.66 
 
 		 510 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.32 
 
 		 494 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.51 
 
 		 381 aa  291  9e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.66 
 
 		 497 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.66 
 
 		 514 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  52.81 
 
 		 491 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  52.81 
 
 		 491 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  52.81 
 
 		 491 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.68 
 
 		 485 aa  290  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  52.98 
 
 		 355 aa  289  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  52.81 
 
 		 491 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  50.16 
 
 		 563 aa  289  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 643 aa  289  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  52.15 
 
 		 511 aa  288  7e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.69 
 
 		 335 aa  288  8e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3317  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 381 aa  288  9e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00314422  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  52.65 
 
 		 355 aa  288  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  52.48 
 
 		 491 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3686  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.33 
 
 		 331 aa  287  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.915822  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  51.14 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.66 
 
 		 310 aa  287  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.49 
 
 		 540 aa  287  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  52.48 
 
 		 498 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.48 
 
 		 497 aa  286  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  52.48 
 
 		 512 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1349  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.49 
 
 		 306 aa  286  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00449425  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  52.48 
 
 		 497 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  52.48 
 
 		 498 aa  286  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  52.48 
 
 		 498 aa  286  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  52.48 
 
 		 498 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  52.48 
 
 		 498 aa  286  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5354  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.49 
 
 		 318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.72 
 
 		 317 aa  285  4e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.83 
 
 		 447 aa  285  5e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0259  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.28 
 
 		 317 aa  285  5.999999999999999e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0102386  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.16 
 
 		 416 aa  285  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.16 
 
 		 416 aa  285  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  52.48 
 
 		 497 aa  285  8e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  51.79 
 
 		 407 aa  285  8e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.99 
 
 		 475 aa  285  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.18 
 
 		 491 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.01 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.16 
 
 		 535 aa  284  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0382  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.33 
 
 		 304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0029967  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.84 
 
 		 397 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  48.52 
 
 		 541 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2903  cell division protein FtsY  52.12 
 
 		 410 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297557  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  49.67 
 
 		 305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0334  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.84 
 
 		 382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0337  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.6 
 
 		 316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124726  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0619  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 347 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124261  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0651  signal recognition particle-docking protein FtsY  47 
 
 		 320 aa  282  5.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  48.36 
 
 		 317 aa  281  7.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.34 
 
 		 329 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.81 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861654 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  49.17 
 
 		 671 aa  280  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.49 
 
 		 523 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4328  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.98 
 
 		 413 aa  280  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  51.49 
 
 		 541 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.66 
 
 		 451 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.01 
 
 		 376 aa  279  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4980  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.63 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  51.49 
 
 		 553 aa  280  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  50.66 
 
 		 408 aa  279  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0962  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 311 aa  279  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000455691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3607  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.36 
 
 		 320 aa  279  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3718  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.33 
 
 		 361 aa  278  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.32 
 
 		 515 aa  278  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0386  putative cell division protein  48.33 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.919397 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.22 
 
 		 487 aa  277  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>