More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0366 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0366  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 294 aa  580  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0348  signal recognition particle-docking protein FtsY  98.64 
 
 		 294 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207618  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.6 
 
 		 295 aa  395  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1768  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.03 
 
 		 304 aa  387  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00021093  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  60.93 
 
 		 350 aa  346  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.93 
 
 		 351 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.81 
 
 		 340 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.28 
 
 		 342 aa  332  6e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1714  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.38 
 
 		 304 aa  320  9.999999999999999e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0632932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  54.49 
 
 		 305 aa  319  3.9999999999999996e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  55 
 
 		 326 aa  318  5e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.48 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.28 
 
 		 309 aa  315  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3297  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.8 
 
 		 409 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0964  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.47 
 
 		 409 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0490186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3317  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.95 
 
 		 381 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.1 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2354  cell division membrane protein  55.3 
 
 		 472 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000763762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  54.15 
 
 		 471 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.93 
 
 		 373 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.95 
 
 		 310 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.49 
 
 		 432 aa  306  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  53.82 
 
 		 495 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.12 
 
 		 320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.3 
 
 		 320 aa  305  7e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.96 
 
 		 485 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  54.97 
 
 		 362 aa  301  6.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.81 
 
 		 301 aa  301  7.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  56.15 
 
 		 497 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  56.15 
 
 		 498 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  56.15 
 
 		 498 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.15 
 
 		 497 aa  301  9e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  56.15 
 
 		 498 aa  301  9e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  56.15 
 
 		 498 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.81 
 
 		 481 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  56.15 
 
 		 498 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  55.81 
 
 		 491 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  56.15 
 
 		 512 aa  301  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  55.81 
 
 		 491 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0651  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.66 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  55.15 
 
 		 511 aa  300  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  55.81 
 
 		 491 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.49 
 
 		 452 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  56.15 
 
 		 497 aa  299  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  55.81 
 
 		 491 aa  298  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  55.48 
 
 		 491 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  51.94 
 
 		 541 aa  298  9e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3686  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.31 
 
 		 331 aa  297  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.915822  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.23 
 
 		 302 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.63 
 
 		 320 aa  296  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.16 
 
 		 416 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.16 
 
 		 416 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.25 
 
 		 643 aa  296  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2659  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.93 
 
 		 389 aa  296  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319125  hitchhiker  0.000261917 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  49.83 
 
 		 408 aa  295  4e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.64 
 
 		 561 aa  295  6e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.09 
 
 		 405 aa  295  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.81 
 
 		 523 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  55.81 
 
 		 553 aa  294  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.79 
 
 		 501 aa  294  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.11 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  55.81 
 
 		 541 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1085  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.48 
 
 		 329 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131602  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1349  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.33 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00449425  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.33 
 
 		 329 aa  292  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  53.33 
 
 		 329 aa  292  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.33 
 
 		 329 aa  292  4e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.33 
 
 		 329 aa  292  4e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0259  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.97 
 
 		 317 aa  292  5e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0102386  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  54.93 
 
 		 355 aa  291  6e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0333  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.38 
 
 		 315 aa  291  7e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0573  hypothetical protein  49.52 
 
 		 311 aa  291  8e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  53 
 
 		 329 aa  291  8e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.28 
 
 		 494 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.33 
 
 		 329 aa  291  9e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.47 
 
 		 491 aa  291  9e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.48 
 
 		 535 aa  291  9e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.61 
 
 		 611 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.61 
 
 		 621 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  54.61 
 
 		 355 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0962  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.12 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000455691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4170  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.92 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.61 
 
 		 615 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0337  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.33 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  53 
 
 		 329 aa  289  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3700  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 377 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.61 
 
 		 540 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 317 aa  289  4e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  53 
 
 		 329 aa  289  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.62 
 
 		 514 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  53 
 
 		 329 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3090  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.31 
 
 		 320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.0202062 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.94 
 
 		 540 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.52 
 
 		 376 aa  288  7e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.95 
 
 		 497 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.75 
 
 		 320 aa  287  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.62 
 
 		 510 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  53 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.92 
 
 		 375 aa  287  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.63 
 
 		 482 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>