More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1768 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1768  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 304 aa  608  1e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00021093  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  70.95 
 
 		 295 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0366  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.03 
 
 		 294 aa  375  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0348  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.35 
 
 		 294 aa  372  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207618  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  51.83 
 
 		 350 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1714  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.64 
 
 		 304 aa  312  4.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0632932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 		 340 aa  308  9e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.84 
 
 		 326 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.16 
 
 		 351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.83 
 
 		 381 aa  306  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.07 
 
 		 309 aa  305  6e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.5 
 
 		 342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.33 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.79 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.94 
 
 		 373 aa  299  4e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.61 
 
 		 501 aa  299  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.16 
 
 		 320 aa  298  6e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.28 
 
 		 312 aa  297  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.16 
 
 		 432 aa  296  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3686  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 331 aa  296  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.915822  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.92 
 
 		 310 aa  295  5e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  52.16 
 
 		 362 aa  295  5e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  50.66 
 
 		 471 aa  293  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.37 
 
 		 485 aa  293  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  51 
 
 		 305 aa  293  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  50.33 
 
 		 495 aa  291  8e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.17 
 
 		 416 aa  291  9e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.17 
 
 		 416 aa  291  9e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.32 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.16 
 
 		 452 aa  288  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.99 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.32 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 320 aa  286  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  49.51 
 
 		 541 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3090  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.32 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.0202062 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.66 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  51.66 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.66 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1588  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.73 
 
 		 518 aa  286  4e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 397 aa  286  4e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.32 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0337  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.63 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.66 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  51.66 
 
 		 329 aa  285  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.99 
 
 		 329 aa  285  5e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1085  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.4 
 
 		 329 aa  285  5e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131602  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.34 
 
 		 481 aa  285  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0962  signal recognition particle-docking protein FtsY  57 
 
 		 301 aa  285  7e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.66 
 
 		 329 aa  285  9e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0964  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.67 
 
 		 409 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0490186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.15 
 
 		 494 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.92 
 
 		 317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.49 
 
 		 405 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0259  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.28 
 
 		 317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0102386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3297  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 		 409 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.42 
 
 		 453 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 		 317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.3 
 
 		 513 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  51.3 
 
 		 505 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.5 
 
 		 301 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0277  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.4 
 
 		 546 aa  282  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.14 
 
 		 329 aa  282  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  52.16 
 
 		 541 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4170  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.47 
 
 		 313 aa  281  8.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.14 
 
 		 514 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.16 
 
 		 523 aa  281  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  48.17 
 
 		 408 aa  281  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.64 
 
 		 535 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  52.16 
 
 		 553 aa  281  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.14 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1715  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.98 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.82 
 
 		 497 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3700  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.64 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.49 
 
 		 510 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3317  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 		 381 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1349  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 		 306 aa  279  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00449425  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  48.69 
 
 		 671 aa  278  7e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0333  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.2 
 
 		 315 aa  278  8e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4980  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.15 
 
 		 317 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0413  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.16 
 
 		 529 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.571496  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.69 
 
 		 477 aa  276  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.71 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2354  cell division membrane protein  50.33 
 
 		 472 aa  276  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000763762  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1925  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  51.6 
 
 		 317 aa  276  3e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0382  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.51 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0029967  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5354  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.6 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.66 
 
 		 561 aa  276  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0359  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 314 aa  275  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000537839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2611  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.32 
 
 		 317 aa  275  7e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  50.83 
 
 		 498 aa  275  9e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  50.83 
 
 		 498 aa  275  9e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.33 
 
 		 320 aa  275  9e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  50.83 
 
 		 497 aa  275  9e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0573  hypothetical protein  47.08 
 
 		 311 aa  275  9e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  50.83 
 
 		 498 aa  275  9e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  50.83 
 
 		 498 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.83 
 
 		 497 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4328  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  50.83 
 
 		 498 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.71 
 
 		 478 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>