More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0623 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 304 aa  617  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861654 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.46 
 
 		 485 aa  330  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.67 
 
 		 452 aa  329  4e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  53.67 
 
 		 471 aa  328  8e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.59 
 
 		 373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  53.67 
 
 		 495 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  53 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  51.62 
 
 		 541 aa  324  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  53.16 
 
 		 350 aa  323  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 326 aa  323  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.46 
 
 		 514 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.13 
 
 		 481 aa  318  6e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.46 
 
 		 510 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.46 
 
 		 494 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.46 
 
 		 497 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 		 453 aa  316  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.67 
 
 		 351 aa  316  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.67 
 
 		 340 aa  316  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  54.33 
 
 		 511 aa  315  6e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  54.28 
 
 		 671 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  52.96 
 
 		 362 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  53.67 
 
 		 491 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  53.67 
 
 		 491 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  53.67 
 
 		 491 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  53.67 
 
 		 491 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  53 
 
 		 541 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  53 
 
 		 553 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  53 
 
 		 523 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.33 
 
 		 447 aa  312  4.999999999999999e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  53 
 
 		 535 aa  311  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  52.98 
 
 		 408 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.16 
 
 		 405 aa  311  9e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  53.33 
 
 		 491 aa  311  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  53 
 
 		 497 aa  311  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  53.33 
 
 		 497 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  53 
 
 		 498 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  53 
 
 		 498 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  53 
 
 		 498 aa  310  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.77 
 
 		 513 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  53.77 
 
 		 505 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  53 
 
 		 498 aa  310  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  53 
 
 		 498 aa  310  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  53 
 
 		 512 aa  310  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.99 
 
 		 342 aa  308  9e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  53 
 
 		 497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.65 
 
 		 387 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.44 
 
 		 451 aa  306  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.97 
 
 		 501 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  55.45 
 
 		 451 aa  305  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  52.98 
 
 		 407 aa  304  9.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  55.12 
 
 		 447 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2753  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.46 
 
 		 316 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2373  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.46 
 
 		 343 aa  301  9e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.119612  hitchhiker  0.000783963 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.99 
 
 		 478 aa  301  1e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.13 
 
 		 515 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 375 aa  299  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.92 
 
 		 320 aa  300  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.83 
 
 		 397 aa  299  4e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.48 
 
 		 312 aa  299  4e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4328  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.16 
 
 		 413 aa  299  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.84 
 
 		 335 aa  298  7e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 477 aa  298  9e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.98 
 
 		 329 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3972  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.16 
 
 		 562 aa  297  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.28 
 
 		 475 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.49 
 
 		 584 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2659  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.82 
 
 		 389 aa  296  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319125  hitchhiker  0.000261917 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.49 
 
 		 643 aa  296  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.83 
 
 		 561 aa  296  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3774  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.49 
 
 		 582 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00390438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 		 376 aa  295  6e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2738  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.64 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3505  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.65 
 
 		 487 aa  294  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000471575  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.01 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.33 
 
 		 491 aa  293  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  50 
 
 		 563 aa  293  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3297  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.83 
 
 		 409 aa  292  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.31 
 
 		 482 aa  291  6e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  49.84 
 
 		 510 aa  291  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2903  cell division protein FtsY  50.66 
 
 		 410 aa  291  7e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297557  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.35 
 
 		 540 aa  291  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 		 320 aa  291  9e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.99 
 
 		 611 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0216  cell division protein  51.32 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.345429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0964  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.5 
 
 		 409 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0490186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.67 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.99 
 
 		 621 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.99 
 
 		 540 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.99 
 
 		 615 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2108  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.99 
 
 		 324 aa  290  3e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.5 
 
 		 295 aa  289  4e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  50.83 
 
 		 355 aa  289  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01431  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.84 
 
 		 311 aa  289  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15526  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  50.83 
 
 		 355 aa  289  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1544  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.49 
 
 		 391 aa  288  6e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3317  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.16 
 
 		 381 aa  287  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00314422  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0673  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.83 
 
 		 444 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.22 
 
 		 309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3700  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.23 
 
 		 377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.68 
 
 		 587 aa  286  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>