46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6494 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  100 
 
 		 1205 aa  2347    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  46.85 
 
 		 836 aa  284  7.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  36.14 
 
 		 287 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  48.59 
 
 		 357 aa  138  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0580  hypothetical protein  38.27 
 
 		 349 aa  131  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.746192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  54.72 
 
 		 507 aa  115  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  47.18 
 
 		 642 aa  105  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2958  hypothetical protein  37.59 
 
 		 155 aa  104  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00527971  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0541  hypothetical protein  37.06 
 
 		 323 aa  102  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2583  hypothetical protein  31.47 
 
 		 144 aa  87  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0020098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3256  hypothetical protein  37.1 
 
 		 147 aa  84  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00588383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2672  hypothetical protein  29.71 
 
 		 155 aa  82.8  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.012888 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5043  hypothetical protein  29.2 
 
 		 155 aa  83.2  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342655 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5045  hypothetical protein  28.47 
 
 		 153 aa  77  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0603131  normal  0.218888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23730  hypothetical protein  29.41 
 
 		 157 aa  76.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.320348 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5047  hypothetical protein  27.08 
 
 		 155 aa  75.5  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00326281  normal  0.22212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4827  hypothetical protein  37.8 
 
 		 310 aa  72.8  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2411  hypothetical protein  33.08 
 
 		 133 aa  72  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4828  hypothetical protein  39.47 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1439  hypothetical protein  33.66 
 
 		 128 aa  68.6  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.651727  normal  0.0352194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8488  hypothetical protein  37.86 
 
 		 125 aa  68.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.991459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2693  hypothetical protein  28.17 
 
 		 549 aa  68.2  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.613106  normal  0.221929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0153  hypothetical protein  40.57 
 
 		 724 aa  66.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6496  hypothetical protein  33.58 
 
 		 156 aa  66.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962762  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5437  hypothetical protein  28.57 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05950  hypothetical protein  35.11 
 
 		 670 aa  64.3  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.846681  normal  0.745522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8531  hypothetical protein  38.75 
 
 		 121 aa  62.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2581  hypothetical protein  31.3 
 
 		 287 aa  60.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00061723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0937  hypothetical protein  36.96 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  36.45 
 
 		 1494 aa  59.3  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1436  hypothetical protein  34.78 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.345358  normal  0.0440159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2584  hypothetical protein  36.25 
 
 		 86 aa  58.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2582  hypothetical protein  32.14 
 
 		 149 aa  56.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00198437  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05353  conserved hypothetical protein  34.78 
 
 		 235 aa  56.2  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00144321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1377  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1059 aa  55.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8530  hypothetical protein  37.38 
 
 		 557 aa  52  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019682 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0366  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  37.21 
 
 		 1571 aa  51.6  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6383  hypothetical protein  36.17 
 
 		 781 aa  51.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1462  hypothetical protein  34.62 
 
 		 112 aa  50.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908272  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4450  hypothetical protein  31.61 
 
 		 324 aa  48.5  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.585946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2241  hypothetical protein  29.23 
 
 		 259 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000987467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0839  hypothetical protein  37.66 
 
 		 660 aa  46.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0823  hypothetical protein  37.66 
 
 		 706 aa  46.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3880  hypothetical protein  34.62 
 
 		 247 aa  46.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6196  hypothetical protein  32.53 
 
 		 309 aa  45.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1560  hypothetical protein  31.25 
 
 		 248 aa  45.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140842  normal  0.393424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>