20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5437 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5437  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  830    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145957  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5043  hypothetical protein  35.97 
 
 
155 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2672  hypothetical protein  32.87 
 
 
155 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.012888 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5047  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00326281  normal  0.22212 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5045  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  89.7  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0603131  normal  0.218888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23730  hypothetical protein  32.19 
 
 
157 aa  89.7  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.320348 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2693  hypothetical protein  35.97 
 
 
549 aa  86.3  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.613106  normal  0.221929 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0541  hypothetical protein  31.94 
 
 
323 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  28.87 
 
 
836 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3256  hypothetical protein  27.74 
 
 
147 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00588383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2583  hypothetical protein  24.82 
 
 
144 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0020098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  29.71 
 
 
357 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  28.17 
 
 
1205 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  29.23 
 
 
287 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2958  hypothetical protein  26.09 
 
 
155 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00527971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2582  hypothetical protein  30.77 
 
 
149 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00198437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2411  hypothetical protein  26.12 
 
 
133 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2584  hypothetical protein  31.25 
 
 
86 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6496  hypothetical protein  24.64 
 
 
156 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  24.24 
 
 
507 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>