27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2693 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2693  hypothetical protein  100 
 
 
549 aa  1087    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.613106  normal  0.221929 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5045  hypothetical protein  32.86 
 
 
153 aa  94.7  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0603131  normal  0.218888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23730  hypothetical protein  35.71 
 
 
157 aa  93.6  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.320348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3256  hypothetical protein  37.4 
 
 
147 aa  90.1  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00588383  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5047  hypothetical protein  30.94 
 
 
155 aa  89  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00326281  normal  0.22212 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5043  hypothetical protein  33.09 
 
 
155 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342655 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5437  hypothetical protein  35.97 
 
 
408 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145957  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2672  hypothetical protein  30.66 
 
 
155 aa  80.9  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.012888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  29.55 
 
 
836 aa  76.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6496  hypothetical protein  35.07 
 
 
156 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962762  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0541  hypothetical protein  26.53 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2583  hypothetical protein  29.2 
 
 
144 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0020098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  27.86 
 
 
1205 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  33.81 
 
 
287 aa  65.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2411  hypothetical protein  29.55 
 
 
133 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  28.24 
 
 
357 aa  62  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2582  hypothetical protein  30.95 
 
 
149 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00198437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2584  hypothetical protein  36.59 
 
 
86 aa  60.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2958  hypothetical protein  28.68 
 
 
155 aa  57.4  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00527971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5966  hypothetical protein  28.47 
 
 
318 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0506264  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4020  hypothetical protein  24.4 
 
 
309 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  28.26 
 
 
507 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0788  hypothetical protein  31.38 
 
 
303 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.887065  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2581  hypothetical protein  25.2 
 
 
287 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00061723  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  28.57 
 
 
642 aa  48.5  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2279  hypothetical protein  30.93 
 
 
299 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2246  hypothetical protein  31.4 
 
 
288 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000540666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>