22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2581 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2581  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  580  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00061723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6496  hypothetical protein  39.5 
 
 		 156 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2582  hypothetical protein  35.25 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00198437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2958  hypothetical protein  30.15 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00527971  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  29.84 
 
 		 836 aa  62.4  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1205 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5043  hypothetical protein  27.86 
 
 		 155 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2583  hypothetical protein  29.85 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0020098  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  29.23 
 
 		 642 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3256  hypothetical protein  26.15 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00588383  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5047  hypothetical protein  27.86 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00326281  normal  0.22212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0541  hypothetical protein  21.58 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2672  hypothetical protein  29.1 
 
 		 155 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.012888 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5045  hypothetical protein  27.74 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0603131  normal  0.218888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23730  hypothetical protein  27.42 
 
 		 157 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.320348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  28.47 
 
 		 357 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  29.1 
 
 		 507 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  26.92 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2584  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211615  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2693  hypothetical protein  25.2 
 
 		 549 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.613106  normal  0.221929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2411  hypothetical protein  25.81 
 
 		 133 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252059  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3198  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  27.45 
 
 		 649 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>