39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6495 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  100 
 
 		 507 aa  996    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  34.63 
 
 		 642 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  38.43 
 
 		 287 aa  171  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  39.85 
 
 		 836 aa  170  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0580  hypothetical protein  50.44 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.746192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  54.72 
 
 		 1205 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  46.34 
 
 		 357 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4828  hypothetical protein  42.15 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2958  hypothetical protein  32.45 
 
 		 155 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00527971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2583  hypothetical protein  33.59 
 
 		 144 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0020098  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4827  hypothetical protein  37.19 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1439  hypothetical protein  39.82 
 
 		 128 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.651727  normal  0.0352194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8531  hypothetical protein  35.83 
 
 		 121 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0153  hypothetical protein  31.53 
 
 		 724 aa  64.7  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8488  hypothetical protein  33.88 
 
 		 125 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.991459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1436  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.345358  normal  0.0440159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05950  hypothetical protein  33.65 
 
 		 670 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.846681  normal  0.745522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8530  hypothetical protein  29.08 
 
 		 557 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6496  hypothetical protein  30.56 
 
 		 156 aa  57  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962762  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0541  hypothetical protein  25.95 
 
 		 323 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2584  hypothetical protein  38.27 
 
 		 86 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211615  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5047  hypothetical protein  25.36 
 
 		 155 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00326281  normal  0.22212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2581  hypothetical protein  29.1 
 
 		 287 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00061723  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2672  hypothetical protein  29.01 
 
 		 155 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.012888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2693  hypothetical protein  28.26 
 
 		 549 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.613106  normal  0.221929 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23730  hypothetical protein  29.77 
 
 		 157 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.320348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3256  hypothetical protein  27.94 
 
 		 147 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00588383  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0937  hypothetical protein  31.4 
 
 		 339 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5043  hypothetical protein  24.81 
 
 		 155 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2411  hypothetical protein  26.4 
 
 		 133 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1377  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1059 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05353  conserved hypothetical protein  34.78 
 
 		 235 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00144321 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1462  hypothetical protein  34.17 
 
 		 112 aa  51.2  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908272  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1494 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6383  hypothetical protein  34.62 
 
 		 781 aa  47.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5437  hypothetical protein  24.24 
 
 		 408 aa  47  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0366  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  37.21 
 
 		 1571 aa  45.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2582  hypothetical protein  27.94 
 
 		 149 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00198437  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3593  hypothetical protein  28 
 
 		 372 aa  43.5  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.609009 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>