26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3593 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3593  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  752    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.609009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4618  hypothetical protein  29.68 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2582  hypothetical protein  36.19 
 
 
149 aa  59.7  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00198437  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5047  hypothetical protein  31.15 
 
 
155 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00326281  normal  0.22212 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5045  hypothetical protein  31.25 
 
 
153 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0603131  normal  0.218888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1560  hypothetical protein  35.37 
 
 
248 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140842  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6496  hypothetical protein  28.43 
 
 
156 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  26.28 
 
 
357 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0580  hypothetical protein  32.98 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.746192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23730  hypothetical protein  32.17 
 
 
157 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.320348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  32 
 
 
836 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2672  hypothetical protein  31 
 
 
155 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.012888 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5043  hypothetical protein  27.35 
 
 
155 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342655 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05353  conserved hypothetical protein  38.54 
 
 
235 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00144321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2583  hypothetical protein  24.65 
 
 
144 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0020098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3256  hypothetical protein  27.62 
 
 
147 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00588383  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05950  hypothetical protein  30.93 
 
 
670 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.846681  normal  0.745522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1377  hypothetical protein  33.68 
 
 
1059 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  23.94 
 
 
287 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4450  hypothetical protein  36.05 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.585946  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0366  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  35.87 
 
 
1571 aa  44.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0839  hypothetical protein  37.18 
 
 
660 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306254  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0823  hypothetical protein  37.18 
 
 
706 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  27.84 
 
 
1205 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  27.72 
 
 
1494 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2958  hypothetical protein  25.37 
 
 
155 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00527971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>