24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5045 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5045  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  320  6e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0603131  normal  0.218888 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5047  hypothetical protein  83.44 
 
 
155 aa  270  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00326281  normal  0.22212 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5043  hypothetical protein  74.5 
 
 
155 aa  237  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2672  hypothetical protein  65.54 
 
 
155 aa  209  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.012888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23730  hypothetical protein  62.25 
 
 
157 aa  209  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.320348 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2693  hypothetical protein  32.86 
 
 
549 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.613106  normal  0.221929 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5437  hypothetical protein  33.33 
 
 
408 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145957  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3256  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00588383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2583  hypothetical protein  31.85 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0020098  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0541  hypothetical protein  32.12 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  36.15 
 
 
287 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6496  hypothetical protein  33.09 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2582  hypothetical protein  35.29 
 
 
149 aa  80.1  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00198437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  31.65 
 
 
836 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2958  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00527971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  28.47 
 
 
1205 aa  78.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  31.85 
 
 
357 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2411  hypothetical protein  32.81 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2584  hypothetical protein  42.86 
 
 
86 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211615  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  27.66 
 
 
642 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3593  hypothetical protein  31.25 
 
 
372 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.609009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2581  hypothetical protein  27.74 
 
 
287 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00061723  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1462  hypothetical protein  30.85 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908272  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  30.88 
 
 
507 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>