23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3256 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3256  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  300  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00588383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0541  hypothetical protein  39.17 
 
 
323 aa  98.2  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2958  hypothetical protein  36.69 
 
 
155 aa  97.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00527971  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5043  hypothetical protein  41.13 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23730  hypothetical protein  40.68 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.320348 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2672  hypothetical protein  37.78 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.012888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2584  hypothetical protein  52.44 
 
 
86 aa  90.9  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211615  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2693  hypothetical protein  37.4 
 
 
549 aa  90.1  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.613106  normal  0.221929 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5045  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  89.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0603131  normal  0.218888 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5047  hypothetical protein  34.33 
 
 
155 aa  87.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00326281  normal  0.22212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  36.07 
 
 
1205 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  32.64 
 
 
357 aa  78.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  33.09 
 
 
836 aa  77  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6496  hypothetical protein  31.11 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2582  hypothetical protein  37.12 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00198437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  31.58 
 
 
287 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5437  hypothetical protein  27.74 
 
 
408 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145957  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1462  hypothetical protein  41.12 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908272  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2583  hypothetical protein  27.34 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0020098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2581  hypothetical protein  26.15 
 
 
287 aa  60.5  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00061723  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  30.95 
 
 
642 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  27.94 
 
 
507 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3593  hypothetical protein  27.62 
 
 
372 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.609009 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>