23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6496 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6496  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  314  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2582  hypothetical protein  39.26 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00198437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2581  hypothetical protein  39.5 
 
 		 287 aa  88.2  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00061723  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5047  hypothetical protein  31.62 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00326281  normal  0.22212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23730  hypothetical protein  37.32 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.320348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  36.43 
 
 		 836 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5045  hypothetical protein  33.09 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0603131  normal  0.218888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0541  hypothetical protein  34.11 
 
 		 323 aa  80.9  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2672  hypothetical protein  32.59 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.012888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3256  hypothetical protein  31.11 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00588383  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5043  hypothetical protein  32.35 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2693  hypothetical protein  35.07 
 
 		 549 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.613106  normal  0.221929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  30.08 
 
 		 357 aa  67.4  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2958  hypothetical protein  29.86 
 
 		 155 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00527971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  33.59 
 
 		 1205 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2584  hypothetical protein  41.43 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2411  hypothetical protein  32.56 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2583  hypothetical protein  36.62 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0020098  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3593  hypothetical protein  28.43 
 
 		 372 aa  55.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.609009 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  30.3 
 
 		 287 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  30.56 
 
 		 507 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  28.91 
 
 		 642 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5437  hypothetical protein  24.64 
 
 		 408 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>