23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2584 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2584  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  174  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211615  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3256  hypothetical protein  52.44 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00588383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0541  hypothetical protein  46.91 
 
 		 323 aa  87.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23730  hypothetical protein  45.88 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.320348 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2672  hypothetical protein  44.71 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.012888 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5047  hypothetical protein  46.15 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00326281  normal  0.22212 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5043  hypothetical protein  42.86 
 
 		 155 aa  72  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342655 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5045  hypothetical protein  42.86 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0603131  normal  0.218888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2582  hypothetical protein  45.95 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00198437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  45.24 
 
 		 287 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6496  hypothetical protein  41.43 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962762  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  45.95 
 
 		 836 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2583  hypothetical protein  42.03 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0020098  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2693  hypothetical protein  36.59 
 
 		 549 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.613106  normal  0.221929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  36.25 
 
 		 1205 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  32.93 
 
 		 357 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1462  hypothetical protein  43.24 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908272  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2958  hypothetical protein  34.57 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00527971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2411  hypothetical protein  33.75 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252059  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5437  hypothetical protein  31.25 
 
 		 408 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2581  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00061723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  37.5 
 
 		 507 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  32.94 
 
 		 642 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.455624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>