24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5047 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5047  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  323  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00326281  normal  0.22212 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5045  hypothetical protein  83.44 
 
 
153 aa  270  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0603131  normal  0.218888 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5043  hypothetical protein  71.61 
 
 
155 aa  239  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23730  hypothetical protein  64.05 
 
 
157 aa  217  6e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.320348 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2672  hypothetical protein  62.75 
 
 
155 aa  208  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.012888 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5437  hypothetical protein  33.33 
 
 
408 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145957  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0541  hypothetical protein  35.71 
 
 
323 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2583  hypothetical protein  31.65 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0020098  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2693  hypothetical protein  30.94 
 
 
549 aa  89  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.613106  normal  0.221929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3256  hypothetical protein  34.33 
 
 
147 aa  87.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00588383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6496  hypothetical protein  31.62 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962762  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  32.37 
 
 
836 aa  85.1  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2958  hypothetical protein  32.61 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00527971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2411  hypothetical protein  35.66 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  30.83 
 
 
287 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  27.08 
 
 
1205 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  30.53 
 
 
357 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2584  hypothetical protein  46.15 
 
 
86 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2582  hypothetical protein  32 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00198437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2581  hypothetical protein  27.86 
 
 
287 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00061723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3593  hypothetical protein  31.15 
 
 
372 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.609009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1462  hypothetical protein  33.7 
 
 
112 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908272  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  25.36 
 
 
507 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  25.74 
 
 
642 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.455624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>