35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23490 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  564  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  41.58 
 
 		 836 aa  198  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  38.35 
 
 		 507 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  33.94 
 
 		 642 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  46.04 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  47.83 
 
 		 1205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5043  hypothetical protein  33.08 
 
 		 155 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2672  hypothetical protein  36.64 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.012888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4827  hypothetical protein  44.79 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5045  hypothetical protein  36.15 
 
 		 153 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0603131  normal  0.218888 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1439  hypothetical protein  40.95 
 
 		 128 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.651727  normal  0.0352194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4828  hypothetical protein  38.6 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5047  hypothetical protein  30.83 
 
 		 155 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00326281  normal  0.22212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1436  hypothetical protein  37.61 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.345358  normal  0.0440159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8488  hypothetical protein  37.19 
 
 		 125 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.991459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23730  hypothetical protein  37.21 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.320348 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0937  hypothetical protein  37.61 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0153  hypothetical protein  42.34 
 
 		 724 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2582  hypothetical protein  31.94 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00198437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2958  hypothetical protein  29.32 
 
 		 155 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00527971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8531  hypothetical protein  40.21 
 
 		 121 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3256  hypothetical protein  31.58 
 
 		 147 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00588383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2584  hypothetical protein  45.24 
 
 		 86 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2411  hypothetical protein  31.58 
 
 		 133 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2583  hypothetical protein  30.08 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0020098  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2693  hypothetical protein  33.81 
 
 		 549 aa  65.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.613106  normal  0.221929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8530  hypothetical protein  30.16 
 
 		 557 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0541  hypothetical protein  27.7 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5437  hypothetical protein  29.23 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6496  hypothetical protein  30.3 
 
 		 156 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2581  hypothetical protein  26.92 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00061723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3593  hypothetical protein  23.94 
 
 		 372 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.609009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1462  hypothetical protein  39.13 
 
 		 112 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908272  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2245  hypothetical protein  32.5 
 
 		 168 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.076861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2241  hypothetical protein  30 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000987467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>