11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2245 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2245  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  345  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.076861  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2241  hypothetical protein  62.13 
 
 
259 aa  217  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000987467  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2243  hypothetical protein  63.95 
 
 
169 aa  210  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0279524  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2246  hypothetical protein  60.95 
 
 
169 aa  210  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.187437  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  32.05 
 
 
1205 aa  44.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  32.5 
 
 
287 aa  44.3  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4828  hypothetical protein  28.92 
 
 
360 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11779  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  27.27 
 
 
836 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8531  hypothetical protein  30.21 
 
 
121 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  31.43 
 
 
642 aa  41.6  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4827  hypothetical protein  27.45 
 
 
310 aa  40.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508343  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>