17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4827 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4827  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4828  hypothetical protein  42.15 
 
 		 360 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1436  hypothetical protein  39.19 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.345358  normal  0.0440159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0937  hypothetical protein  32.17 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8530  hypothetical protein  39.06 
 
 		 557 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8488  hypothetical protein  45.38 
 
 		 125 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.991459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8531  hypothetical protein  45.45 
 
 		 121 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  44.79 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  39.32 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  40.71 
 
 		 836 aa  72.4  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  36.94 
 
 		 507 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  37.8 
 
 		 1205 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1439  hypothetical protein  36.79 
 
 		 128 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.651727  normal  0.0352194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  39.13 
 
 		 642 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0153  hypothetical protein  34.67 
 
 		 724 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2241  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000987467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2246  hypothetical protein  27.37 
 
 		 169 aa  42.4  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.187437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>