17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0937 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0937  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  663    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1436  hypothetical protein  65.68 
 
 
356 aa  431  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.345358  normal  0.0440159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4828  hypothetical protein  34.22 
 
 
360 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11779  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4827  hypothetical protein  32.17 
 
 
310 aa  105  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508343  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8488  hypothetical protein  52.69 
 
 
125 aa  95.9  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.991459  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8530  hypothetical protein  33.83 
 
 
557 aa  86.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1439  hypothetical protein  38.61 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.651727  normal  0.0352194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  37.61 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8531  hypothetical protein  45.12 
 
 
121 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  35.51 
 
 
836 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  36.96 
 
 
1205 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  34.74 
 
 
357 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0242  hypothetical protein  30.21 
 
 
203 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  36.63 
 
 
642 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  31.73 
 
 
507 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36180  hypothetical protein  28.65 
 
 
210 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0243  hypothetical protein  28.3 
 
 
414 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>