15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8488 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8488  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  251  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.991459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4828  hypothetical protein  44.92 
 
 		 360 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4827  hypothetical protein  45.38 
 
 		 310 aa  97.1  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0937  hypothetical protein  52.69 
 
 		 339 aa  95.1  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1436  hypothetical protein  51.61 
 
 		 356 aa  95.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.345358  normal  0.0440159 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1439  hypothetical protein  45.87 
 
 		 128 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.651727  normal  0.0352194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8531  hypothetical protein  40.32 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8530  hypothetical protein  41.84 
 
 		 557 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  37.19 
 
 		 287 aa  77  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  37.86 
 
 		 1205 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  33.33 
 
 		 507 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  35.79 
 
 		 357 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  34.62 
 
 		 836 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  31.82 
 
 		 642 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0153  hypothetical protein  30.95 
 
 		 724 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>