13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0153 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0153  hypothetical protein  100 
 
 		 724 aa  1434    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  29.17 
 
 		 836 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  42.34 
 
 		 287 aa  70.5  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37930  hypothetical protein  35.66 
 
 		 177 aa  68.2  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.350424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  40.57 
 
 		 1205 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  37.38 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  26.84 
 
 		 507 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1439  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.651727  normal  0.0352194 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.56 
 
 		 2449 aa  53.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  33.66 
 
 		 642 aa  51.2  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4828  hypothetical protein  33.66 
 
 		 360 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4827  hypothetical protein  34.67 
 
 		 310 aa  46.6  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8531  hypothetical protein  34.12 
 
 		 121 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>