15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1439 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1439  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  259  6.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.651727  normal  0.0352194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8488  hypothetical protein  43.86 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.991459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1436  hypothetical protein  40.4 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.345358  normal  0.0440159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  40.95 
 
 		 287 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0937  hypothetical protein  38.61 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  37.5 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  34.71 
 
 		 836 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  41.18 
 
 		 507 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8530  hypothetical protein  40.59 
 
 		 557 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4828  hypothetical protein  37.86 
 
 		 360 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  33.03 
 
 		 1205 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8531  hypothetical protein  42.71 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4827  hypothetical protein  36.79 
 
 		 310 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0153  hypothetical protein  38.46 
 
 		 724 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  30.83 
 
 		 642 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.455624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>