17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1436 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1436  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  709    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.345358  normal  0.0440159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0937  hypothetical protein  65.68 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4828  hypothetical protein  34.6 
 
 		 360 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4827  hypothetical protein  39.19 
 
 		 310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8488  hypothetical protein  51.61 
 
 		 125 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.991459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1439  hypothetical protein  40.4 
 
 		 128 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.651727  normal  0.0352194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8530  hypothetical protein  35.75 
 
 		 557 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  37.61 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  37.04 
 
 		 836 aa  66.6  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  35.9 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1205 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8531  hypothetical protein  40.58 
 
 		 121 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  37.5 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36170  hypothetical protein  32.8 
 
 		 415 aa  53.1  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0243  hypothetical protein  31.55 
 
 		 414 aa  49.7  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308396  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  32.67 
 
 		 642 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36180  hypothetical protein  28.5 
 
 		 210 aa  42.7  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>