17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4828 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4828  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  699    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4827  hypothetical protein  43.02 
 
 		 310 aa  195  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1436  hypothetical protein  33.53 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.345358  normal  0.0440159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0937  hypothetical protein  34.22 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8530  hypothetical protein  33.22 
 
 		 557 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8488  hypothetical protein  44.92 
 
 		 125 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.991459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8531  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  41.96 
 
 		 507 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  38.6 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  39.42 
 
 		 1205 aa  70.5  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1439  hypothetical protein  37.86 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.651727  normal  0.0352194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  37.14 
 
 		 836 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  37.7 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  46.81 
 
 		 642 aa  53.5  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0153  hypothetical protein  33.66 
 
 		 724 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36180  hypothetical protein  27.23 
 
 		 210 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2245  hypothetical protein  28.92 
 
 		 168 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.076861  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>