34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5505 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  694    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  35.49 
 
 		 287 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  48.59 
 
 		 1205 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  46.21 
 
 		 836 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2958  hypothetical protein  39.26 
 
 		 155 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00527971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  47.71 
 
 		 507 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2672  hypothetical protein  34.81 
 
 		 155 aa  89.4  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.012888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  43.22 
 
 		 642 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5043  hypothetical protein  34.07 
 
 		 155 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23730  hypothetical protein  35.61 
 
 		 157 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.320348 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0541  hypothetical protein  33.59 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2583  hypothetical protein  31.62 
 
 		 144 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0020098  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1439  hypothetical protein  39.25 
 
 		 128 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.651727  normal  0.0352194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3256  hypothetical protein  32.85 
 
 		 147 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00588383  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5045  hypothetical protein  31.82 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0603131  normal  0.218888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4827  hypothetical protein  39.32 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5047  hypothetical protein  30.53 
 
 		 155 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00326281  normal  0.22212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4828  hypothetical protein  37.7 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5437  hypothetical protein  29.71 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6496  hypothetical protein  30.08 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2411  hypothetical protein  30.4 
 
 		 133 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8531  hypothetical protein  41.38 
 
 		 121 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0153  hypothetical protein  37.38 
 
 		 724 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8488  hypothetical protein  35.79 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.991459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2693  hypothetical protein  28.24 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.613106  normal  0.221929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2584  hypothetical protein  33.72 
 
 		 86 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211615  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0937  hypothetical protein  34.74 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2582  hypothetical protein  32.41 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00198437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1436  hypothetical protein  37.5 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.345358  normal  0.0440159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3593  hypothetical protein  26.28 
 
 		 372 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.609009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2581  hypothetical protein  28.47 
 
 		 287 aa  52.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00061723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8530  hypothetical protein  32.65 
 
 		 557 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019682 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  33.59 
 
 		 2914 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1462  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908272  normal  0.273161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>