24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23730 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_23730  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  322  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.320348 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5043  hypothetical protein  71.34 
 
 		 155 aa  239  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342655 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5047  hypothetical protein  64.05 
 
 		 155 aa  217  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00326281  normal  0.22212 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5045  hypothetical protein  62.25 
 
 		 153 aa  209  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0603131  normal  0.218888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2672  hypothetical protein  60.96 
 
 		 155 aa  192  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.012888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2693  hypothetical protein  35.71 
 
 		 549 aa  93.6  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.613106  normal  0.221929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3256  hypothetical protein  40.68 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00588383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0541  hypothetical protein  37.59 
 
 		 323 aa  90.9  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5437  hypothetical protein  32.19 
 
 		 408 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2583  hypothetical protein  33.1 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0020098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  35.61 
 
 		 357 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2958  hypothetical protein  35.51 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00527971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6496  hypothetical protein  37.32 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962762  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  33.08 
 
 		 836 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1205 aa  77.4  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  37.21 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2584  hypothetical protein  45.88 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2582  hypothetical protein  36.5 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00198437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2411  hypothetical protein  34.35 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252059  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1462  hypothetical protein  34.51 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908272  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2581  hypothetical protein  27.42 
 
 		 287 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00061723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3593  hypothetical protein  32.17 
 
 		 372 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.609009 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  26 
 
 		 642 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  27.69 
 
 		 507 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>