24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2958 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2958  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  313  7e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00527971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2583  hypothetical protein  41.3 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0020098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  36.96 
 
 		 1205 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  39.26 
 
 		 357 aa  100  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3256  hypothetical protein  36.69 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00588383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0541  hypothetical protein  38.24 
 
 		 323 aa  97.4  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  34.31 
 
 		 836 aa  86.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2672  hypothetical protein  33.81 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.012888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23730  hypothetical protein  35.51 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.320348 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5047  hypothetical protein  32.61 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00326281  normal  0.22212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  32.45 
 
 		 507 aa  81.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0603131  normal  0.218888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2411  hypothetical protein  34.59 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252059  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5043  hypothetical protein  31.16 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1462  hypothetical protein  38.94 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908272  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  29.32 
 
 		 287 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6496  hypothetical protein  29.86 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962762  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  32.06 
 
 		 642 aa  64.3  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2581  hypothetical protein  30.15 
 
 		 287 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00061723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2582  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00198437  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5437  hypothetical protein  26.09 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2693  hypothetical protein  28.68 
 
 		 549 aa  57.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.613106  normal  0.221929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2584  hypothetical protein  34.57 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211615  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3593  hypothetical protein  25.37 
 
 		 372 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.609009 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>