15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8530 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8530  hypothetical protein  100 
 
 
557 aa  1085    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4828  hypothetical protein  33.44 
 
 
360 aa  112  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11779  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4827  hypothetical protein  39.06 
 
 
310 aa  101  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508343  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0937  hypothetical protein  33.44 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1436  hypothetical protein  33.55 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.345358  normal  0.0440159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8488  hypothetical protein  41.84 
 
 
125 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.991459  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1439  hypothetical protein  40.59 
 
 
128 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.651727  normal  0.0352194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23490  hypothetical protein  30.16 
 
 
287 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000349785  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  29.08 
 
 
507 aa  57.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0242  hypothetical protein  29.95 
 
 
203 aa  55.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  37.38 
 
 
1205 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8531  hypothetical protein  39.47 
 
 
121 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36180  hypothetical protein  27.78 
 
 
210 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5505  hypothetical protein  32.65 
 
 
357 aa  47.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0832194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  31.82 
 
 
836 aa  45.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>