22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05950 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05950  hypothetical protein  100 
 
 		 670 aa  1300    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.846681  normal  0.745522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6383  hypothetical protein  49.33 
 
 		 781 aa  177  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1377  hypothetical protein  43.17 
 
 		 1059 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  29.87 
 
 		 2914 aa  70.5  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  44.58 
 
 		 836 aa  65.1  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0580  hypothetical protein  36.73 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.746192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  35.11 
 
 		 1205 aa  63.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1560  hypothetical protein  36.14 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140842  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7413  hypothetical protein  27.45 
 
 		 966 aa  57.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38108  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6495  hypothetical protein  33.65 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05353  conserved hypothetical protein  35.58 
 
 		 235 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00144321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0738  hypothetical protein  32.58 
 
 		 164 aa  54.7  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1494 aa  53.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3880  hypothetical protein  35.56 
 
 		 247 aa  52  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0936  hypothetical protein  30.71 
 
 		 3677 aa  50.8  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6196  hypothetical protein  28.37 
 
 		 309 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0839  hypothetical protein  44.16 
 
 		 660 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0823  hypothetical protein  44.16 
 
 		 706 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3593  hypothetical protein  30.93 
 
 		 372 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.609009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1421  hypothetical protein  34.25 
 
 		 164 aa  45.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0816911  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4618  hypothetical protein  44 
 
 		 325 aa  43.9  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0366  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  36.05 
 
 		 1571 aa  43.9  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>