13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7413 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7413  hypothetical protein  100 
 
 		 966 aa  1937    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38108  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1737  hypothetical protein  39.06 
 
 		 919 aa  161  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0936  hypothetical protein  30.45 
 
 		 3677 aa  125  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9191  hypothetical protein  28.82 
 
 		 2213 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1435  hypothetical protein  29.51 
 
 		 3437 aa  95.9  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0503508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1217  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 7422 aa  89.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.446236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0483  hypothetical protein  27.6 
 
 		 3754 aa  82.8  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.38288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2525  hypothetical protein  23.53 
 
 		 2247 aa  81.3  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1215  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1275 aa  76.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0816157  normal  0.554588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8529  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1939 aa  71.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667602  normal  0.0232783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05950  hypothetical protein  27.45 
 
 		 670 aa  57  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.846681  normal  0.745522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0738  hypothetical protein  27.01 
 
 		 164 aa  54.7  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428858  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  20.34 
 
 		 5185 aa  49.7  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>