16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1560 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1560  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140842  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3880  hypothetical protein  36.73 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05353  conserved hypothetical protein  34.85 
 
 		 235 aa  115  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00144321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6196  hypothetical protein  37.44 
 
 		 309 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1377  hypothetical protein  40.66 
 
 		 1059 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05950  hypothetical protein  36.59 
 
 		 670 aa  59.3  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.846681  normal  0.745522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  38.46 
 
 		 836 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  33.62 
 
 		 1494 aa  56.6  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3593  hypothetical protein  37.04 
 
 		 372 aa  55.5  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.609009 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0839  hypothetical protein  33.85 
 
 		 660 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0823  hypothetical protein  33.85 
 
 		 706 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0580  hypothetical protein  30.7 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.746192 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0366  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  37.89 
 
 		 1571 aa  51.2  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39590  hypothetical protein  32.47 
 
 		 642 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1205 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6383  hypothetical protein  34.26 
 
 		 781 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>