14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3880 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3880  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  488  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05353  conserved hypothetical protein  46.33 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00144321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6196  hypothetical protein  41.67 
 
 
309 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361257  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1560  hypothetical protein  36.73 
 
 
248 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140842  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04980  hypothetical protein  42.86 
 
 
836 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  32.62 
 
 
1494 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05950  hypothetical protein  34.92 
 
 
670 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.846681  normal  0.745522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1377  hypothetical protein  44 
 
 
1059 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0580  hypothetical protein  36.59 
 
 
349 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.746192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0823  hypothetical protein  38.61 
 
 
706 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0839  hypothetical protein  38.61 
 
 
660 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306254  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6494  hypothetical protein  35.9 
 
 
1205 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226417  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0366  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  37.63 
 
 
1571 aa  45.4  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4618  hypothetical protein  30.97 
 
 
325 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal  0.459764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>